Untemplated Nonenzymatic Polymerization of 3 ',5 ' cGMP: A Plausible Route to 3 ',5 '-Linked Oligonucleotides in Primordia
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F15%3A00082892" target="_blank" >RIV/00216224:14740/15:00082892 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/68081707:_____/15:00446343
Výsledek na webu
<a href="http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jpcb.5b00601" target="_blank" >http://pubs.acs.org/doi/pdf/10.1021/acs.jpcb.5b00601</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1021/acs.jpcb.5b00601" target="_blank" >10.1021/acs.jpcb.5b00601</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Untemplated Nonenzymatic Polymerization of 3 ',5 ' cGMP: A Plausible Route to 3 ',5 '-Linked Oligonucleotides in Primordia
Popis výsledku v původním jazyce
The high-energy 3',5' phosphodiester linkages conserved in 3',5' cyclic GMPs offer a genuine solution for monomer activation required by the transphosphorylation reactions that could lead to the emergence of the first simple oligonucleotide sequences onthe early Earth. In this work we provide an in-depth characterization of the effect of the reaction conditions on the yield of the polymerization reaction of 3',5' cyclic GMPs both in aqueous environment as well as under dehydrating conditions. We show that the threshold temperature of the polymerization is about 30 degrees C lower under dehydrating conditions than in solution. In addition, we present a plausible exergonic reaction pathway for the polymerization reaction, which involves transient formation of anionic centers at the O3' positions of the participating riboses. We suggest that excess Na+ cations inhibit the polymerization reaction because they block the anionic mechanism via neutralizing the negatively charged O3'.
Název v anglickém jazyce
Untemplated Nonenzymatic Polymerization of 3 ',5 ' cGMP: A Plausible Route to 3 ',5 '-Linked Oligonucleotides in Primordia
Popis výsledku anglicky
The high-energy 3',5' phosphodiester linkages conserved in 3',5' cyclic GMPs offer a genuine solution for monomer activation required by the transphosphorylation reactions that could lead to the emergence of the first simple oligonucleotide sequences onthe early Earth. In this work we provide an in-depth characterization of the effect of the reaction conditions on the yield of the polymerization reaction of 3',5' cyclic GMPs both in aqueous environment as well as under dehydrating conditions. We show that the threshold temperature of the polymerization is about 30 degrees C lower under dehydrating conditions than in solution. In addition, we present a plausible exergonic reaction pathway for the polymerization reaction, which involves transient formation of anionic centers at the O3' positions of the participating riboses. We suggest that excess Na+ cations inhibit the polymerization reaction because they block the anionic mechanism via neutralizing the negatively charged O3'.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Physical Chemistry B
ISSN
1520-6106
e-ISSN
—
Svazek periodika
119
Číslo periodika v rámci svazku
7
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
2979-2989
Kód UT WoS článku
000349942300021
EID výsledku v databázi Scopus
—