Rapid Identification of Medically Important Candida Isolates Using High Resolution Melting Analysis
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F15%3A00084545" target="_blank" >RIV/00216224:14740/15:00084545 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00159816:_____/15:00062585 RIV/00209775:_____/15:#0000326
Výsledek na webu
<a href="http://www.plosone.org/article/fetchObject.action?uri=info:doi/10.1371/journal.pone.0116940&representation=PDF" target="_blank" >http://www.plosone.org/article/fetchObject.action?uri=info:doi/10.1371/journal.pone.0116940&representation=PDF</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0116940" target="_blank" >10.1371/journal.pone.0116940</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Rapid Identification of Medically Important Candida Isolates Using High Resolution Melting Analysis
Popis výsledku v původním jazyce
An increasing trend in non albicans infections and various susceptibility patterns to antifungal agents implies a requirement for the quick and reliable identification of a number of medically important Candida species. Real-time PCR followed by high resolution melting analysis (HRMA) was developed, tested on 25 reference Candida collection strains and validated on an additional 143 clinical isolates in this study. All reference strains and clinical isolates inconclusive when using phenotypic methods and/or HRMA were analysed using ITS2 sequencing. Considering reference and clinical strains together, 23 out of 27 Candida species could be clearly distinguished by HRMA, while the remaining 4 species were grouped in 2 pairs, when applying the mean Tm +/-3 SD values, the shape of the derivative melting curve (dMelt curve) and, in some cases, the normalized and temperature-shifted difference plot against C. krusei.
Název v anglickém jazyce
Rapid Identification of Medically Important Candida Isolates Using High Resolution Melting Analysis
Popis výsledku anglicky
An increasing trend in non albicans infections and various susceptibility patterns to antifungal agents implies a requirement for the quick and reliable identification of a number of medically important Candida species. Real-time PCR followed by high resolution melting analysis (HRMA) was developed, tested on 25 reference Candida collection strains and validated on an additional 143 clinical isolates in this study. All reference strains and clinical isolates inconclusive when using phenotypic methods and/or HRMA were analysed using ITS2 sequencing. Considering reference and clinical strains together, 23 out of 27 Candida species could be clearly distinguished by HRMA, while the remaining 4 species were grouped in 2 pairs, when applying the mean Tm +/-3 SD values, the shape of the derivative melting curve (dMelt curve) and, in some cases, the normalized and temperature-shifted difference plot against C. krusei.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
FN - Epidemiologie, infekční nemoci a klinická imunologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/ED1.100%2F02%2F0123" target="_blank" >ED1.100/02/0123: Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně - Mezinárodní centrum klinického výzkumu (FNUSA - ICRC)</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Plos one
ISSN
1932-6203
e-ISSN
—
Svazek periodika
10
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
15
Strana od-do
"nestránkováno"
Kód UT WoS článku
000350322700028
EID výsledku v databázi Scopus
—