TUT-DIS3L2 is a mammalian surveillance pathway for aberrant structured non-coding RNAs
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F16%3A00088170" target="_blank" >RIV/00216224:14740/16:00088170 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://emboj.embopress.org/content/early/2016/09/19/embj.201694857" target="_blank" >http://emboj.embopress.org/content/early/2016/09/19/embj.201694857</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.15252/embj.201694857" target="_blank" >10.15252/embj.201694857</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
TUT-DIS3L2 is a mammalian surveillance pathway for aberrant structured non-coding RNAs
Popis výsledku v původním jazyce
Uridylation of various cellular RNA species at the 3' end has been generally linked to RNA degradation. In mammals, uridylated pre-let-7 miRNAs and mRNAs are targeted by the 3' to 5' exoribonuclease DIS3L2. Mutations in DIS3L2 have been associated with Perlman syndrome and with Wilms tumor susceptibility. Using in vivo cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) method, we discovered the DIS3L2-dependent cytoplasmic uridylome of human cells. We found a broad spectrum of uridylated RNAs including rRNAs, snRNAs, snoRNAs, tRNAs, vault, 7SL, Y RNAs, mRNAs, lncRNAs, and transcripts from pseudogenes. The unifying features of most of these identified RNAs are aberrant processing and the presence of stable secondary structures. Most importantly, we demonstrate that uridylation mediates DIS3L2 degradation of short RNA polymerase II-derived RNAs. Our findings establish the role of DIS3L2 and oligouridylation as the cytoplasmic quality control for highly structured ncRNAs.
Název v anglickém jazyce
TUT-DIS3L2 is a mammalian surveillance pathway for aberrant structured non-coding RNAs
Popis výsledku anglicky
Uridylation of various cellular RNA species at the 3' end has been generally linked to RNA degradation. In mammals, uridylated pre-let-7 miRNAs and mRNAs are targeted by the 3' to 5' exoribonuclease DIS3L2. Mutations in DIS3L2 have been associated with Perlman syndrome and with Wilms tumor susceptibility. Using in vivo cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) method, we discovered the DIS3L2-dependent cytoplasmic uridylome of human cells. We found a broad spectrum of uridylated RNAs including rRNAs, snRNAs, snoRNAs, tRNAs, vault, 7SL, Y RNAs, mRNAs, lncRNAs, and transcripts from pseudogenes. The unifying features of most of these identified RNAs are aberrant processing and the presence of stable secondary structures. Most importantly, we demonstrate that uridylation mediates DIS3L2 degradation of short RNA polymerase II-derived RNAs. Our findings establish the role of DIS3L2 and oligouridylation as the cytoplasmic quality control for highly structured ncRNAs.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
EMBO JOURNAL
ISSN
0261-4189
e-ISSN
—
Svazek periodika
35
Číslo periodika v rámci svazku
20
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
13
Strana od-do
2179-2191
Kód UT WoS článku
000385708000003
EID výsledku v databázi Scopus
—