Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

TUT-DIS3L2 is a mammalian surveillance pathway for aberrant structured non-coding RNAs

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F16%3A00088170" target="_blank" >RIV/00216224:14740/16:00088170 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://emboj.embopress.org/content/early/2016/09/19/embj.201694857" target="_blank" >http://emboj.embopress.org/content/early/2016/09/19/embj.201694857</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.15252/embj.201694857" target="_blank" >10.15252/embj.201694857</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    TUT-DIS3L2 is a mammalian surveillance pathway for aberrant structured non-coding RNAs

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Uridylation of various cellular RNA species at the 3' end has been generally linked to RNA degradation. In mammals, uridylated pre-let-7 miRNAs and mRNAs are targeted by the 3' to 5' exoribonuclease DIS3L2. Mutations in DIS3L2 have been associated with Perlman syndrome and with Wilms tumor susceptibility. Using in vivo cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) method, we discovered the DIS3L2-dependent cytoplasmic uridylome of human cells. We found a broad spectrum of uridylated RNAs including rRNAs, snRNAs, snoRNAs, tRNAs, vault, 7SL, Y RNAs, mRNAs, lncRNAs, and transcripts from pseudogenes. The unifying features of most of these identified RNAs are aberrant processing and the presence of stable secondary structures. Most importantly, we demonstrate that uridylation mediates DIS3L2 degradation of short RNA polymerase II-derived RNAs. Our findings establish the role of DIS3L2 and oligouridylation as the cytoplasmic quality control for highly structured ncRNAs.

  • Název v anglickém jazyce

    TUT-DIS3L2 is a mammalian surveillance pathway for aberrant structured non-coding RNAs

  • Popis výsledku anglicky

    Uridylation of various cellular RNA species at the 3' end has been generally linked to RNA degradation. In mammals, uridylated pre-let-7 miRNAs and mRNAs are targeted by the 3' to 5' exoribonuclease DIS3L2. Mutations in DIS3L2 have been associated with Perlman syndrome and with Wilms tumor susceptibility. Using in vivo cross-linking and immunoprecipitation (CLIP) method, we discovered the DIS3L2-dependent cytoplasmic uridylome of human cells. We found a broad spectrum of uridylated RNAs including rRNAs, snRNAs, snoRNAs, tRNAs, vault, 7SL, Y RNAs, mRNAs, lncRNAs, and transcripts from pseudogenes. The unifying features of most of these identified RNAs are aberrant processing and the presence of stable secondary structures. Most importantly, we demonstrate that uridylation mediates DIS3L2 degradation of short RNA polymerase II-derived RNAs. Our findings establish the role of DIS3L2 and oligouridylation as the cytoplasmic quality control for highly structured ncRNAs.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    CE - Biochemie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2016

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    EMBO JOURNAL

  • ISSN

    0261-4189

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    35

  • Číslo periodika v rámci svazku

    20

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

    2179-2191

  • Kód UT WoS článku

    000385708000003

  • EID výsledku v databázi Scopus