H19 Noncoding RNA, an Independent Prognostic Factor, Regulates Essential Rb-E2F and CDK8-beta-Catenin Signaling in Colorectal Cancer
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F16%3A00093867" target="_blank" >RIV/00216224:14740/16:00093867 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235239641630487X" target="_blank" >http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S235239641630487X</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.ebiom.2016.10.026" target="_blank" >10.1016/j.ebiom.2016.10.026</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
H19 Noncoding RNA, an Independent Prognostic Factor, Regulates Essential Rb-E2F and CDK8-beta-Catenin Signaling in Colorectal Cancer
Popis výsledku v původním jazyce
The clinical significance of long noncoding RNAs (lncRNAs) in colorectal cancer (CRC) remains largely unexplored. Here, we analyzed a large panel of lncRNA candidates with The Cancer Genome Atlas (TCGA) CRC dataset, and identified H19 as the most significant lncRNA associated with CRC patient survival. We further validated such association in two independent CRC cohorts. H19 silencing blocked G1-S transition, reduced cell proliferation, and inhibited cell migration. We profiled gene expression changes to gain mechanism insight of H19 function. Transcriptome data analysis revealed not only previously identified mechanisms such as Let-7 regulation by H19, but also RB1-E2F1 function and beta-catenin activity as essential upstream regulators mediating H19 function. Our experimental data showed that H19 affects phosphorylation of RB1 protein by regulating gene expression of CDK4 and CCND1.
Název v anglickém jazyce
H19 Noncoding RNA, an Independent Prognostic Factor, Regulates Essential Rb-E2F and CDK8-beta-Catenin Signaling in Colorectal Cancer
Popis výsledku anglicky
The clinical significance of long noncoding RNAs (lncRNAs) in colorectal cancer (CRC) remains largely unexplored. Here, we analyzed a large panel of lncRNA candidates with The Cancer Genome Atlas (TCGA) CRC dataset, and identified H19 as the most significant lncRNA associated with CRC patient survival. We further validated such association in two independent CRC cohorts. H19 silencing blocked G1-S transition, reduced cell proliferation, and inhibited cell migration. We profiled gene expression changes to gain mechanism insight of H19 function. Transcriptome data analysis revealed not only previously identified mechanisms such as Let-7 regulation by H19, but also RB1-E2F1 function and beta-catenin activity as essential upstream regulators mediating H19 function. Our experimental data showed that H19 affects phosphorylation of RB1 protein by regulating gene expression of CDK4 and CCND1.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
FD - Onkologie a hematologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/LQ1601" target="_blank" >LQ1601: CEITEC 2020</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
EBioMedicine
ISSN
2352-3964
e-ISSN
—
Svazek periodika
13
Číslo periodika v rámci svazku
November
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
12
Strana od-do
113-124
Kód UT WoS článku
000390704800027
EID výsledku v databázi Scopus
—