Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

The map-based genome sequence of Spirodela polyrhiza aligned with its chromosomes, a reference for karyotype evolution

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F16%3A00093897" target="_blank" >RIV/00216224:14740/16:00093897 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.13592/abstract;jsessionid=45B89E4181F4C0B55B0226C67A998584.f04t02?systemMessage=Wiley+Online+Library+will+be+unavailable+on+Saturday+25th+March+from+07%3A00+GMT+%2F+03%3A00+EDT+%2F+15%3A00+SGT+for+4+hours+fo" target="_blank" >http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.13592/abstract;jsessionid=45B89E4181F4C0B55B0226C67A998584.f04t02?systemMessage=Wiley+Online+Library+will+be+unavailable+on+Saturday+25th+March+from+07%3A00+GMT+%2F+03%3A00+EDT+%2F+15%3A00+SGT+for+4+hours+fo</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1111/nph.13592" target="_blank" >10.1111/nph.13592</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    The map-based genome sequence of Spirodela polyrhiza aligned with its chromosomes, a reference for karyotype evolution

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Duckweeds are aquatic monocotyledonous plants of potential economic interest with fast vegetative propagation, comprising 37 species with variable genome sizes (0.158-1.88 Gbp). The genomic sequence of Spirodela polyrhiza, the smallest and the most ancient duckweed genome, needs to be aligned to its chromosomes as a reference and prerequisite to study the genome and karyotype evolution of other duckweed species. We selected physically mapped bacterial artificial chromosomes (BACs) containing Spirodela DNA inserts with little or no repetitive elements as probes for multicolor fluorescence in situ hybridization (mcFISH), using an optimized BAC pooling strategy, to validate its physical map and correlate it with its chromosome complement. By consecutive mcFISH analyses, we assigned the originally assembled 32 pseudomolecules (supercontigs) of the genomic sequences to the 20 chromosomes of S. polyrhiza. A Spirodela cytogenetic map containing 96 BAC markers with an average distance of 0.

  • Název v anglickém jazyce

    The map-based genome sequence of Spirodela polyrhiza aligned with its chromosomes, a reference for karyotype evolution

  • Popis výsledku anglicky

    Duckweeds are aquatic monocotyledonous plants of potential economic interest with fast vegetative propagation, comprising 37 species with variable genome sizes (0.158-1.88 Gbp). The genomic sequence of Spirodela polyrhiza, the smallest and the most ancient duckweed genome, needs to be aligned to its chromosomes as a reference and prerequisite to study the genome and karyotype evolution of other duckweed species. We selected physically mapped bacterial artificial chromosomes (BACs) containing Spirodela DNA inserts with little or no repetitive elements as probes for multicolor fluorescence in situ hybridization (mcFISH), using an optimized BAC pooling strategy, to validate its physical map and correlate it with its chromosome complement. By consecutive mcFISH analyses, we assigned the originally assembled 32 pseudomolecules (supercontigs) of the genomic sequences to the 20 chromosomes of S. polyrhiza. A Spirodela cytogenetic map containing 96 BAC markers with an average distance of 0.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/EE2.3.20.0189" target="_blank" >EE2.3.20.0189: Rozvoj výzkumné excelence v oblasti evoluční cytogenomiky, epigenetiky a buněčné signalizace</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2016

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    New Phytologist

  • ISSN

    0028-646X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    209

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    354-363

  • Kód UT WoS článku

    000365393700035

  • EID výsledku v databázi Scopus