Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F17%3A00094448" target="_blank" >RIV/00216224:14740/17:00094448 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://github.com/infspiredBAT/GLASS" target="_blank" >https://github.com/infspiredBAT/GLASS</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
GLASS
Popis výsledku v původním jazyce
Motivation: Sanger sequencing is still being employed for sequence variant detection by many laboratories, especially in a clinical setting. However, chromatogram interpretation often requires manual inspection and in some cases, considerable expertise. Results: We present GLASS, a web-based Sanger sequence trace viewer, editor, aligner and variant caller, built to assist with the assessment of variations in 'curated' or user-provided genes. Critically, it produces a standardized variant output as recommended by the Human Genome Variation Society.
Název v anglickém jazyce
GLASS
Popis výsledku anglicky
Motivation: Sanger sequencing is still being employed for sequence variant detection by many laboratories, especially in a clinical setting. However, chromatogram interpretation often requires manual inspection and in some cases, considerable expertise. Results: We present GLASS, a web-based Sanger sequence trace viewer, editor, aligner and variant caller, built to assist with the assessment of variations in 'curated' or user-provided genes. Critically, it produces a standardized variant output as recommended by the Human Genome Variation Society.
Klasifikace
Druh
R - Software
CEP obor
—
OECD FORD obor
10600 - Biological sciences
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2017
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
infspiredBAT/GLASS
Technické parametry
Výsledkem je Webová aplikace. Zdrojový kód přístúpný přes GitHub. Zdrojový kód napsán primárne v jayzce R a JavaScript.
Ekonomické parametry
Zdrojový kód vydán pod licencií GPL-3.0
IČO vlastníka výsledku
00216224
Název vlastníka
CEITEC MU