Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

CDK12 controls G1/S progression by regulating RNAPII processivity at core DNA replication genes

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F19%3A00107754" target="_blank" >RIV/00216224:14740/19:00107754 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00159816:_____/19:00072493

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.embopress.org/doi/full/10.15252/embr.201847592" target="_blank" >https://www.embopress.org/doi/full/10.15252/embr.201847592</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.15252/embr.201847592" target="_blank" >10.15252/embr.201847592</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    CDK12 controls G1/S progression by regulating RNAPII processivity at core DNA replication genes

  • Popis výsledku v původním jazyce

    CDK12 is a kinase associated with elongating RNA polymerase II (RNAPII) and is frequently mutated in cancer. CDK12 depletion reduces the expression of homologous recombination (HR) DNA repair genes, but comprehensive insight into its target genes and cellular processes is lacking. We use a chemical genetic approach to inhibit analog-sensitive CDK12, and find that CDK12 kinase activity is required for transcription of core DNA replication genes and thus for G1/S progression. RNA-seq and ChIP-seq reveal that CDK12 inhibition triggers an RNAPII processivity defect characterized by a loss of mapped reads from 3 ' ends of predominantly long, poly(A)-signal-rich genes. CDK12 inhibition does not globally reduce levels of RNAPII-Ser2 phosphorylation. However, individual CDK12-dependent genes show a shift of P-Ser2 peaks into the gene body approximately to the positions where RNAPII occupancy and transcription were lost. Thus, CDK12 catalytic activity represents a novel link between regulation of transcription and cell cycle progression. We propose that DNA replication and HR DNA repair defects as a consequence of CDK12 inactivation underlie the genome instability phenotype observed in many cancers.

  • Název v anglickém jazyce

    CDK12 controls G1/S progression by regulating RNAPII processivity at core DNA replication genes

  • Popis výsledku anglicky

    CDK12 is a kinase associated with elongating RNA polymerase II (RNAPII) and is frequently mutated in cancer. CDK12 depletion reduces the expression of homologous recombination (HR) DNA repair genes, but comprehensive insight into its target genes and cellular processes is lacking. We use a chemical genetic approach to inhibit analog-sensitive CDK12, and find that CDK12 kinase activity is required for transcription of core DNA replication genes and thus for G1/S progression. RNA-seq and ChIP-seq reveal that CDK12 inhibition triggers an RNAPII processivity defect characterized by a loss of mapped reads from 3 ' ends of predominantly long, poly(A)-signal-rich genes. CDK12 inhibition does not globally reduce levels of RNAPII-Ser2 phosphorylation. However, individual CDK12-dependent genes show a shift of P-Ser2 peaks into the gene body approximately to the positions where RNAPII occupancy and transcription were lost. Thus, CDK12 catalytic activity represents a novel link between regulation of transcription and cell cycle progression. We propose that DNA replication and HR DNA repair defects as a consequence of CDK12 inactivation underlie the genome instability phenotype observed in many cancers.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10400 - Chemical sciences

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    EMBO reports

  • ISSN

    1469-221X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    20

  • Číslo periodika v rámci svazku

    9

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    29

  • Strana od-do

    1-29

  • Kód UT WoS článku

    000486091900003

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85070278188