Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Primary and secondary anti-viral response captured by the dynamics and phenotype of individual T cell clones

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F20%3A00118340" target="_blank" >RIV/00216224:14740/20:00118340 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://elifesciences.org/articles/53704" target="_blank" >https://elifesciences.org/articles/53704</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.7554/eLife.53704" target="_blank" >10.7554/eLife.53704</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Primary and secondary anti-viral response captured by the dynamics and phenotype of individual T cell clones

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The diverse repertoire of T-cell receptors (TCR) plays a key role in the adaptive immune response to infections. Using TCR alpha and beta repertoire sequencing for T-cell subsets, as well as single-cell RNAseq and TCRseq, we track the concentrations and phenotypes of individual T-cell clones in response to primary and secondary yellow fever immunization - the model for acute infection in humans - showing their large diversity. We confirm the secondary response is an order of magnitude weaker, albeit similar to 10 days faster than the primary one. Estimating the fraction of the T-cell response directed against the single immunodominant epitope, we identify the sequence features of TCRs that define the high precursor frequency of the two major TCR motifs specific for this particular epitope. We also show the consistency of clonal expansion dynamics between bulk alpha and beta repertoires, using a new methodology to reconstruct alpha-beta pairings from clonal trajectories.

  • Název v anglickém jazyce

    Primary and secondary anti-viral response captured by the dynamics and phenotype of individual T cell clones

  • Popis výsledku anglicky

    The diverse repertoire of T-cell receptors (TCR) plays a key role in the adaptive immune response to infections. Using TCR alpha and beta repertoire sequencing for T-cell subsets, as well as single-cell RNAseq and TCRseq, we track the concentrations and phenotypes of individual T-cell clones in response to primary and secondary yellow fever immunization - the model for acute infection in humans - showing their large diversity. We confirm the secondary response is an order of magnitude weaker, albeit similar to 10 days faster than the primary one. Estimating the fraction of the T-cell response directed against the single immunodominant epitope, we identify the sequence features of TCRs that define the high precursor frequency of the two major TCR motifs specific for this particular epitope. We also show the consistency of clonal expansion dynamics between bulk alpha and beta repertoires, using a new methodology to reconstruct alpha-beta pairings from clonal trajectories.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    elife

  • ISSN

    2050-084X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    9

  • Číslo periodika v rámci svazku

    FEB

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    21

  • Strana od-do

    53704

  • Kód UT WoS článku

    000518830000001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85081944059