Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

In-Cell NMR Spectroscopy of Functional Riboswitch Aptamers in Eukaryotic Cells

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F21%3A00118818" target="_blank" >RIV/00216224:14740/21:00118818 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/68081707:_____/20:00536199 RIV/68081707:_____/21:00536199

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1002/anie.202007184" target="_blank" >https://doi.org/10.1002/anie.202007184</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/anie.202007184" target="_blank" >10.1002/anie.202007184</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    In-Cell NMR Spectroscopy of Functional Riboswitch Aptamers in Eukaryotic Cells

  • Popis výsledku v původním jazyce

    We report here the in-cell NMR-spectroscopic observation of the binding of the cognate ligand 2 '-deoxyguanosine to the aptamer domain of the bacterial 2 '-deoxyguanosine-sensing riboswitch in eukaryotic cells, namely Xenopus laevis oocytes and in human HeLa cells. The riboswitch is sufficiently stable in both cell types to allow for detection of binding of the ligand to the riboswitch. Most importantly, we show that the binding mode established by in vitro characterization of this prokaryotic riboswitch is maintained in eukaryotic cellular environment. Our data also bring important methodological insights: Thus far, in-cell NMR studies on RNA in mammalian cells have been limited to investigations of short (&lt;15 nt) RNA fragments that were extensively modified by protecting groups to limit their degradation in the intracellular space. Here, we show that the in-cell NMR setup can be adjusted for characterization of much larger (approximate to 70 nt) functional and chemically non-modified RNA.

  • Název v anglickém jazyce

    In-Cell NMR Spectroscopy of Functional Riboswitch Aptamers in Eukaryotic Cells

  • Popis výsledku anglicky

    We report here the in-cell NMR-spectroscopic observation of the binding of the cognate ligand 2 '-deoxyguanosine to the aptamer domain of the bacterial 2 '-deoxyguanosine-sensing riboswitch in eukaryotic cells, namely Xenopus laevis oocytes and in human HeLa cells. The riboswitch is sufficiently stable in both cell types to allow for detection of binding of the ligand to the riboswitch. Most importantly, we show that the binding mode established by in vitro characterization of this prokaryotic riboswitch is maintained in eukaryotic cellular environment. Our data also bring important methodological insights: Thus far, in-cell NMR studies on RNA in mammalian cells have been limited to investigations of short (&lt;15 nt) RNA fragments that were extensively modified by protecting groups to limit their degradation in the intracellular space. Here, we show that the in-cell NMR setup can be adjusted for characterization of much larger (approximate to 70 nt) functional and chemically non-modified RNA.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2021

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Angewandte Chemie International Edition

  • ISSN

    1433-7851

  • e-ISSN

    1521-3773

  • Svazek periodika

    60

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    865-872

  • Kód UT WoS článku

    000591274200001

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85096655060