Bioinformatický nástroj pro zpracování NGS dat a uživatelské rozhraní - LYNX

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F21%3A00129461" target="_blank" >RIV/00216224:14740/21:00129461 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://lynx.ceitec.muni.cz/" target="_blank" >https://lynx.ceitec.muni.cz/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—

Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Bioinformatický nástroj pro zpracování NGS dat a uživatelské rozhraní - LYNX
Popis výsledku v původním jazyce
LYNX je webový interaktivní bioinformatický nástroj pro analýzu dat získaných cíleným sekvenováním nové generace. Výpočetní algoritmy implementované v nástroji poskytují informace o mutacích ve vybraných genech, změnách v počtu kopií DNA, translokacích a přestavbách antigenních receptorů u nejběžnějších lymfoidních malignit. Všechny tyto informace jsou prezentovány prostřednictvím interaktivních tabulek a grafů v uživatelském rozhraní.
Název v anglickém jazyce
Bioinformatic tool with a user interface for NGS data analysis - LYNX
Popis výsledku anglicky
LYNX is a web-based interactive bioinformatic tool for the analysis of targeted next-generation sequencing data. Computational pipelines implemented in the tool provide information about mutations in selected genes, copy number variations across the genome, translocations, and rearrangements of antigen receptors in the most common lymphoid malignancies. All this information is presented via interactive tables and graphs in a user interface.

Projekt
<a href="/cs/project/TJ02000133" target="_blank" >TJ02000133: Vývoj modulární bioinformatické platformy pro analýzu dat získaných sekvenováním nové generace</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění
2021
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu
LYNX
Technické parametry
Software LYNX je bioinformatická pipeline s webovým rozhraním. Pipeline se skládá z volně dostupných programů a vlastního kódu zejména v programovacích jazycích Perl, Python a Snakemake. Uživatelské prostředí komunikující s výpočetní pipeline je naprogramované v jazyce JavaScript.
Ekonomické parametry
Výsledek projektu, který je ve společném vlastnictví Masarykovy univerzity a HPST, s.r.o., jsou oba vlastníci oprávněni samostatně užívat pro nekomerční užití bezúplatně. Pro poskytnutí licence nebo podlicence třetí osobě je třeba souhlasu obou vlastníků. Vlastníci budou využívat výsledek projektu k vědeckým, výukovým a výzkumným činnostem.
IČO vlastníka výsledku
00216224
Název vlastníka
Masarykova univerzita

Podobné výsledky(10)