Varianta v genu CYCS způsobující trombocytopenii 4 zvyšuje kaspázovou aktivitu.
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F23%3A00132799" target="_blank" >RIV/00216224:14740/23:00132799 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://cytogenomika2023.cz/" target="_blank" >https://cytogenomika2023.cz/</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Varianta v genu CYCS způsobující trombocytopenii 4 zvyšuje kaspázovou aktivitu.
Popis výsledku v původním jazyce
Vrozené trombocytopenie jsou heterogenní skupinou vzácných onemocnění. Vznikají v důsledku genetických variant ve více než 40 genech účastnících se megakaryopoézy a trombopoézy včetně genu CYCS kódujícího cytochrom c (Cysc). Cysc se rovněž účastní buněčného dýchání a aktivace kaspáz, a tím iniciace apoptózy. Doposud bylo popsáno šest různých variant vv genu CYCS způsobujících mírnou formu onemocnění - trombocyxtopenii typu 4. Zde uvádíme variantu NP_061820.1:p(Thr2%Ile) v genu CYCS identifikovanou celoexonovým sekvenováním a její funkční dopad. Varianta segreguje s trombocytopenií ve třech generacích u čtyř členů české rodiny. Pomocí technologie CRISPR/Cas9 byl u lidské megakaryoblastické buněčné linie MEG-01 gen CYCS geneticky modifikován na identifikovanou variantu p.(Thr20Ile). Následně byl sledován vliv na 1) expresi Cycs genu metodou western blot a na 2) mitochondriální aktivitu pomocí testu XFp Cell Mito Stress Test Kit na přístroji Seahorse, 3) aktivaci kaspáz metodou založenou na luminiscenci a průtokovou cytometrii (FCM), 4) expresi povrchových antigenů (FCM) a 5) ploidií (FCM).
Název v anglickém jazyce
A variant in the CYCS gene causing thrombocytopenia 4 increases caspase activity.
Popis výsledku anglicky
Congenital thrombocytopenias are a heterogeneous group of rare diseases. They arise as a result of genetic variants in more than 40 genes involved in megakaryopoiesis and thrombopoiesis, including the CYCS gene encoding cytochrome c (Cysc). Cysc is also involved in cellular respiration and activation of caspases, thereby initiating apoptosis. So far, six different variants in the CYCS gene have been described causing a mild form of the disease - thrombocyxtopenia type 4. Here we present the variant NP_061820.1:p(Thr2%Ile) in the CYCS gene identified by whole-exon sequencing and its functional impact. The variant segregates with thrombocytopenia in three generations in four members of a Czech family. Using CRISPR/Cas9 technology, the CYCS gene was genetically modified to the identified variant p.(Thr20Ile) in the human megakaryoblastic cell line MEG-01.
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
—
OECD FORD obor
30205 - Hematology
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2023
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů