Visualization of the Nucleolus Using 5′ Ethynyl Uridine

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F23%3A00139586" target="_blank" >RIV/00216224:14740/23:00139586 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-0716-3226-0_24" target="_blank" >https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-0716-3226-0_24</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1007/978-1-0716-3226-0_24" target="_blank" >10.1007/978-1-0716-3226-0_24</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Visualization of the Nucleolus Using 5′ Ethynyl Uridine

Popis výsledku v původním jazyce

Labeling of the nucleolus in Arabidopsis thaliana can be achieved by incorporation of 5′-ethynyl uridine (EU) into bulk RNA. Although EU does not selectively label the nucleolus, the abundance of ribosomal transcripts results in the predominant accumulation of the signal in the nucleolus. Ethynyl uridine has the advantage of being detected via Click-iT chemistry providing a specific signal and low background. While the protocol presented here employs fluorescent dye and allows visualization of the nucleolus by microscopy, this method can also be used for other downstream applications. Though we tested nucleolar labeling only in A. thaliana, in principle it can be applied to other plant species.

Název v anglickém jazyce

Visualization of the Nucleolus Using 5′ Ethynyl Uridine

Popis výsledku anglicky

Labeling of the nucleolus in Arabidopsis thaliana can be achieved by incorporation of 5′-ethynyl uridine (EU) into bulk RNA. Although EU does not selectively label the nucleolus, the abundance of ribosomal transcripts results in the predominant accumulation of the signal in the nucleolus. Ethynyl uridine has the advantage of being detected via Click-iT chemistry providing a specific signal and low background. While the protocol presented here employs fluorescent dye and allows visualization of the nucleolus by microscopy, this method can also be used for other downstream applications. Though we tested nucleolar labeling only in A. thaliana, in principle it can be applied to other plant species.

Druh

C - Kapitola v odborné knize

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název knihy nebo sborníku

Methods in Molecular Biology, volume 2672

ISBN

9781071632253

Počet stran výsledku

9

Strana od-do

377-385

Počet stran knihy

568

Název nakladatele

Springer Nature, Humana Press

Místo vydání

New York, USA

Kód UT WoS kapitoly

—