MOLEonline: a web-based tool for analysing channels, tunnels and pores (2025 update)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216224%3A14740%2F25%3A00141978" target="_blank" >RIV/00216224:14740/25:00141978 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61989592:15310/25:73631984
Výsledek na webu
<a href="https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/btaf486/8246808" target="_blank" >https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/btaf486/8246808</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btaf486" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/btaf486</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
MOLEonline: a web-based tool for analysing channels, tunnels and pores (2025 update)
Popis výsledku v původním jazyce
MOLEonline is an interactive, web-based tool designed to detect and analyse channels (pores and tunnels) within protein structures. The latest version of MOLEonline addresses the limitations of its predecessor by integrating the Mol* viewer for visualisation and offering a streamlined, fully interactive user experience. The new features include colouring tunnels in the 3D viewer based on their physicochemical properties. A 2D representation of the protein structure and calculated tunnels is generated using 2DProts. Users can now store tunnels directly in the mmCIF file format, facilitating sharing via the community-standard FAIR format for structural data. In addition, the ability to store and load computation settings ensures the reproducibility of tunnel computation results. Integration with the ChannelsDB 2.0 database allows users to access precomputed tunnels.
Název v anglickém jazyce
MOLEonline: a web-based tool for analysing channels, tunnels and pores (2025 update)
Popis výsledku anglicky
MOLEonline is an interactive, web-based tool designed to detect and analyse channels (pores and tunnels) within protein structures. The latest version of MOLEonline addresses the limitations of its predecessor by integrating the Mol* viewer for visualisation and offering a streamlined, fully interactive user experience. The new features include colouring tunnels in the 3D viewer based on their physicochemical properties. A 2D representation of the protein structure and calculated tunnels is generated using 2DProts. Users can now store tunnels directly in the mmCIF file format, facilitating sharing via the community-standard FAIR format for structural data. In addition, the ability to store and load computation settings ensures the reproducibility of tunnel computation results. Integration with the ChannelsDB 2.0 database allows users to access precomputed tunnels.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
30101 - Human genetics
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2025
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Bioinformatics
ISSN
1367-4803
e-ISSN
1367-4811
Svazek periodika
41
Číslo periodika v rámci svazku
9
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
„btaf486“
Kód UT WoS článku
001574587700001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-105016706722