MOLEonline

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F25%3A73631985" target="_blank" >RIV/61989592:15310/25:73631985 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://moleonline.cz/" target="_blank" >https://moleonline.cz/</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

MOLEonline

Popis výsledku v původním jazyce

MOLEonline is an interactive, web-based tool designed to detect and analyse channels (pores and tunnels) within protein structures. The latest version of MOLEonline addresses the limitations of its predecessor by integrating the Mol* viewer for visualization and offering a streamlined, fully interactive user experience. The new features include colouring tunnels in the 3D viewer based on their physicochemical properties. A 2D representation of the protein structure and calculated tunnels is generated using 2DProts. Users can now store tunnels directly in the mmCIF file format, facilitating sharing via the community-standard FAIR format for structural data. In addition, the ability to store and load computation settings ensures the reproducibility of tunnel computation results. Integration with the ChannelsDB 2.0 database allows users to access precomputed tunnels.

Název v anglickém jazyce

MOLEonline

Popis výsledku anglicky

MOLEonline is an interactive, web-based tool designed to detect and analyse channels (pores and tunnels) within protein structures. The latest version of MOLEonline addresses the limitations of its predecessor by integrating the Mol* viewer for visualization and offering a streamlined, fully interactive user experience. The new features include colouring tunnels in the 3D viewer based on their physicochemical properties. A 2D representation of the protein structure and calculated tunnels is generated using 2DProts. Users can now store tunnels directly in the mmCIF file format, facilitating sharing via the community-standard FAIR format for structural data. In addition, the ability to store and load computation settings ensures the reproducibility of tunnel computation results. Integration with the ChannelsDB 2.0 database allows users to access precomputed tunnels.

Druh

R - Software

CEP obor

—

OECD FORD obor

10403 - Physical chemistry

Projekt

<a href="/cs/project/LM2023055" target="_blank" >LM2023055: Česká národní infrastruktura pro biologická data</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2025

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

Webová aplikace MoleOnline

Technické parametry

Jedná se o aplikaci klient/server, kde na straně serveru je zapotřebí Apache web server s PHP a databázový server MySQL.Na straně klienta je pak vyžadovaný internetový prohlížeč v aktualizované verzi.

Ekonomické parametry

Aplikace MOLEonline přináší ekonomický přínos zejména zkrácením času a snížením nákladů na analýzu proteinových struktur díky plně webovému, interaktivnímu prostředí a přístupu k předpočítaným datům z ChannelsDB 2.0. Umožněním snadného sdílení, opakovatelnosti výpočtů a využití standardizovaných formátů (FAIR, mmCIF) zvyšuje efektivitu výzkumu a urychluje přenos výsledků do aplikovaného výzkumu, například ve vývoji léčiv či biotechnologiích.

IČO vlastníka výsledku

61989592

Název vlastníka

Univerzita Palackého Olomouc