LipidQuant 1.0: automated data processing in lipid class separation–mass spectrometry quantitative workflows

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216275%3A25310%2F21%3A39917846" target="_blank" >RIV/00216275:25310/21:39917846 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/37/23/4591/6366545?redirectedFrom=fulltext" target="_blank" >https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/37/23/4591/6366545?redirectedFrom=fulltext</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btab644" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/btab644</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

LipidQuant 1.0: automated data processing in lipid class separation–mass spectrometry quantitative workflows

Popis výsledku v původním jazyce

We present the LipidQuant 1.0 tool for automated data processing workflows in lipidomic quantitation based on lipid class separation coupled with high-resolution mass spectrometry. Lipid class separation workflows, such as hydrophilic interaction liquid chromatography or supercritical fluid chromatography, should be preferred in lipidomic quantitation due to the coionization of lipid class internal standards with analytes from the same class. The individual steps in the LipidQuant workflow are explained, including lipid identification, quantitation, isotopic correc- tion and reporting results. We show the application of LipidQuant data processing to a small cohort of human serum samples.

Název v anglickém jazyce

LipidQuant 1.0: automated data processing in lipid class separation–mass spectrometry quantitative workflows

Popis výsledku anglicky

We present the LipidQuant 1.0 tool for automated data processing workflows in lipidomic quantitation based on lipid class separation coupled with high-resolution mass spectrometry. Lipid class separation workflows, such as hydrophilic interaction liquid chromatography or supercritical fluid chromatography, should be preferred in lipidomic quantitation due to the coionization of lipid class internal standards with analytes from the same class. The individual steps in the LipidQuant workflow are explained, including lipid identification, quantitation, isotopic correc- tion and reporting results. We show the application of LipidQuant data processing to a small cohort of human serum samples.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Projekt

<a href="/cs/project/GA21-20238S" target="_blank" >GA21-20238S: Spojení vícerozměrné chromatografie a hmotnostní spektrometrie v kvantitativních přístupech pro detailní charakterizaci lipidomu lidské plazmy</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Bioinformatics

ISSN

1367-4803

e-ISSN

—

Svazek periodika

37

Číslo periodika v rámci svazku

23

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

4591-4592

Kód UT WoS článku

000733374500047

EID výsledku v databázi Scopus

2-s2.0-85117406938