Specifikace identifikace dat z tandemové hmotnostní spektrometrie
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F09%3APU81431" target="_blank" >RIV/00216305:26220/09:PU81431 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Specification and simplified analyzing data from MS/MS spectrometry
Popis výsledku v původním jazyce
The goal of this work was to design a suitable method for unifying score values from various identification tools of proteins identification in tandem mass spectrometry into a single score value. Output data from the mass spectrometric method were processed by two independent search tools Mascot and X!Tandem. Those were selected especially for their wide applications in proteomic laboratories. Results of both methods were evaluated through a newly designed function and unified to a single valued score that clearly identifies found proteins. The newly designed function of producing of scored values was termed Metascore and implemented into MATLAB computational environment. Given results were successfully tested on selected real data available in publicdatabases of proteomic sequences
Název v anglickém jazyce
Specification and simplified analyzing data from MS/MS spectrometry
Popis výsledku anglicky
The goal of this work was to design a suitable method for unifying score values from various identification tools of proteins identification in tandem mass spectrometry into a single score value. Output data from the mass spectrometric method were processed by two independent search tools Mascot and X!Tandem. Those were selected especially for their wide applications in proteomic laboratories. Results of both methods were evaluated through a newly designed function and unified to a single valued score that clearly identifies found proteins. The newly designed function of producing of scored values was termed Metascore and implemented into MATLAB computational environment. Given results were successfully tested on selected real data available in publicdatabases of proteomic sequences
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
CE - Biochemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GD102%2F09%2FH083" target="_blank" >GD102/09/H083: Informační technologie v biomedicínském inženýrství</a><br>
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2009
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Proc. World Congress of Medical Physics and Biomedical Engineering
ISBN
978-3-642-03881-5
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
3
Strana od-do
—
Název nakladatele
IFMBE
Místo vydání
Neuveden
Místo konání akce
Mnichov
Datum konání akce
7. 9. 2009
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
—