Analyzátor pro tvorbu a vyhodnocení fylogenetické stromové struktury
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F10%3APR24648" target="_blank" >RIV/00216305:26220/10:PR24648 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Analyzátor pro tvorbu a vyhodnocení fylogenetické stromové struktury
Popis výsledku v původním jazyce
Software pro rekonstrukci fylogenetických stromů získaných pomocí různých známých metod s nastavením vstupních parametrů fylogenetické analýzy jako jsou: skórovací matice, výpočet vzájemné distance, rekonstrukční algoritmus, cena mezer apod. U získané stromové struktury dále program umožňuje srovnání metod a analýzu biologických sekvencí pomocí bootstrappingových technik a klastrování s nastavitelnými vstupními kritérii.
Název v anglickém jazyce
Analyzer for reconstruction and evaluation of phylogenetic tree structure
Popis výsledku anglicky
Software for reconstruction and analysis of phylogenetic tree using several different methods with setting of input parameters as: scoring matrixes, distance matrix methods, algorithm for reconstruction, penalties for opening gaps etc.
Klasifikace
Druh
R - Software
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GD102%2F09%2FH083" target="_blank" >GD102/09/H083: Informační technologie v biomedicínském inženýrství</a><br>
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
FYLOGEN
Technické parametry
Vývojové prostředí: Matlab 2009b Kompilátor: Matlab Compiler s Visual C++, pro spuštění programu nutný MCRruntime Umožňuje zpracovat sekvence aminokyselin ve standardizovaném formátu FASTA nezávisle na délce nebo počtu sekvencí. Grafi
Ekonomické parametry
—
IČO vlastníka výsledku
00216305
Název vlastníka
Ústav biomedicínského inženýrství