PhyloGenSig - Software pro konstruci fylogramů z genomických signálů
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F13%3APR26845" target="_blank" >RIV/00216305:26220/13:PR26845 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty" target="_blank" >http://www.ubmi.feec.vutbr.cz/vyzkum-a-vyvoj/produkty</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
PhyloGenSig - Software pro konstruci fylogramů z genomických signálů
Popis výsledku v původním jazyce
Program umožňuje konvertovat DNA sekvence na genomické signály, provést kompresi pro extrémně dlouhé signály (celogenomové průběhy), zarovnat signály pomocí DTW, vyhodnotit jejich podobnost a sestrojit fylogram.
Název v anglickém jazyce
PhyloGenSig - Software for construction phylogram from genomic signals
Popis výsledku anglicky
The program allows you to convert DNA sequence of the genomic signals, perform compression for extremely long signals (genome sequences), align signals using DTW, evaluate their similarities and construct phylogram.
Klasifikace
Druh
R - Software
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GAP102%2F11%2F1068" target="_blank" >GAP102/11/1068: Nano-elektro-bio-nástroje pro biochemické a molekulárně-biologické studie eukaryotických buněk (NanoBioTECell)</a><br>
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Interní identifikační kód produktu
PhyloGenSig
Technické parametry
Software byl realizován jako výsledek projektu GAČR GD102/09/H083: Informační technologie v biomedicínském inženýrství. Produkt je využíván na VUT v Brně, na Mendelově univerzitě v Brně a Centrem pokročilých studií Fakulty vojenského zdravotnictví Univerzity obrany v Hradci Králové. Pro spuštění je zapotřebí Matlab R2011a (nebo vyšší verze) + Bioinformatics toolbox.
Ekonomické parametry
cena 50.000,- Kč
IČO vlastníka výsledku
00216305
Název vlastníka
Ústav biomedicínského inženýrství