DNA reads feature extraction analysis

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F17%3APU124431" target="_blank" >RIV/00216305:26220/17:PU124431 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

DNA reads feature extraction analysis

Popis výsledku v původním jazyce

As the price of genome sequencing decreased, the complete genome sequencing is the new standard for exploring biological abilities of organisms. The commonly known contaminants like proteins and RNA are efficiently ousted but there is another contaminant which is diverse DNA. DNA contaminants are common in sequencing output and until recently nobody reckons with it, they are also part of already published genomes. The paper deals with issues by using alternative approach of genomic signal processing and other computational methods. The main objective is to detect contaminants in sequencing output and evaluate the analyses of usable features.

Název v anglickém jazyce

DNA reads feature extraction analysis

Popis výsledku anglicky

As the price of genome sequencing decreased, the complete genome sequencing is the new standard for exploring biological abilities of organisms. The commonly known contaminants like proteins and RNA are efficiently ousted but there is another contaminant which is diverse DNA. DNA contaminants are common in sequencing output and until recently nobody reckons with it, they are also part of already published genomes. The paper deals with issues by using alternative approach of genomic signal processing and other computational methods. The main objective is to detect contaminants in sequencing output and evaluate the analyses of usable features.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

20201 - Electrical and electronic engineering

Projekt

<a href="/cs/project/GA17-01821S" target="_blank" >GA17-01821S: Výkonnostní techniky pro sestavování a anotaci bakteriálního genomu využívající číslicové zpracování genomických signálů</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Proceedings of IEEE Student Branch Conference Mikulov 2017

ISBN

978-80-214-5526-9

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

33-36

Název nakladatele

Neuveden

Místo vydání

Neuveden

Místo konání akce

Mikulov, Czech republic

Datum konání akce

28. 8. 2017

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—