Celogenomové srovnání organismů pomocí signálového zpracování
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F13%3APU105654" target="_blank" >RIV/00216305:26220/13:PU105654 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Celogenomové srovnání organismů pomocí signálového zpracování
Popis výsledku v původním jazyce
Srovnání celých genomů organismů ve formě genomických číslicových signálů přináší nové možnosti analýzy DNA, které v klasickém ?symbolovém? zpracování nukleových kyselin nebyly možné. Zachovává většinu klasických technik pro analýzu genomických dat, jakojsou: zarovnání sekvencí, fylogenetická analýza, mapování genu, vyhledání strukturálních podobností apod. Ty však mnohonásobně urychluje a snižuje výpočetní náročnost pro velké objemy dat. Tím zpřístupňuje velké srovnávací studie celých genomů více organismů, které dříve zabraly celým týmům i několik let. Možnosti číslicového zpracování genomických dat jsou demonstrovány na srovnávací studii nejaktuálnějších záznamů genomů člověka a šimpanze.
Název v anglickém jazyce
Celogenomové srovnání organismů pomocí signálového zpracování
Popis výsledku anglicky
The representation of the whole genome of species by genomic signals allows using new techniques for DNA analysis, which was not possible in classical symbols expression. Moreover, the most of common methods for DNA analysis as sequence alignment, phylogenetic analysis, gene mapping or structural comparison remain usable for genomic signals, but with multiple speed up processing especially for large data sets. It makes available large comparison studies of the whole genomes from several different species together, which previously took months even years of whole scientific teams. In this paper, the potential of genomic signal processing is demonstrated on comparative study of the most current records of human and chimpanzee genomes. The structural changes are evaluated for each pair of whole chromosomes of both very evolutionary close primates.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GAP102%2F11%2F1068" target="_blank" >GAP102/11/1068: Nano-elektro-bio-nástroje pro biochemické a molekulárně-biologické studie eukaryotických buněk (NanoBioTECell)</a><br>
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Trendy v biomedicínskom inžinierstve 2013
ISBN
978-80-8086-208-4
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
1-5
Název nakladatele
Neuveden
Místo vydání
Neuveden
Místo konání akce
Podbanské, Vysoké Tatry
Datum konání akce
3. 7. 2013
Typ akce podle státní příslušnosti
CST - Celostátní akce
Kód UT WoS článku
—