Cross-Correlation Based Detection of Contigs Overlaps
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26220%2F18%3APU128835" target="_blank" >RIV/00216305:26220/18:PU128835 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=8400030" target="_blank" >https://ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=8400030</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.23919/MIPRO.2018.8400030" target="_blank" >10.23919/MIPRO.2018.8400030</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Cross-Correlation Based Detection of Contigs Overlaps
Popis výsledku v původním jazyce
The current methods use string algorithms based on dynamic programming computing with characters (A, C, G, T) representing nucleotides, but if applied to long sequences, e.g. contigs, they tend to be time-consuming. We applied another approach based on genomic signal processing to evaluate the further merging and overlaps between the contigs.
Název v anglickém jazyce
Cross-Correlation Based Detection of Contigs Overlaps
Popis výsledku anglicky
The current methods use string algorithms based on dynamic programming computing with characters (A, C, G, T) representing nucleotides, but if applied to long sequences, e.g. contigs, they tend to be time-consuming. We applied another approach based on genomic signal processing to evaluate the further merging and overlaps between the contigs.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
—
OECD FORD obor
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/GA17-01821S" target="_blank" >GA17-01821S: Výkonnostní techniky pro sestavování a anotaci bakteriálního genomu využívající číslicové zpracování genomických signálů</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2018
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
MIPRO 2018 proceedings
ISBN
978-953-233-095-3
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
155-158
Název nakladatele
IEEE
Místo vydání
New York
Místo konání akce
Opatija
Datum konání akce
21. 5. 2018
Typ akce podle státní příslušnosti
WRD - Celosvětová akce
Kód UT WoS článku
000630901400030