Clustering of Protein Sequences

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216305%3A26230%2F06%3APU86203" target="_blank" >RIV/00216305:26230/06:PU86203 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Clustering of Protein Sequences

Popis výsledku v původním jazyce

Clustering of protein sequences is one of the techniques that can be helpful for predicting secondary structure of protein. Clustering methods are based on expressing similarity or dissimilarity of such sequences. The similarity of two protein sequencescan be assessed by the score of the best alignment of the sequences. The paper deals with using formal model theory in describing this important task of bioinformatics. First, a well-known Needleman and Wunsch algorithm for finding the best alignment isintroduced. Then a finite automaton that can compute the score for the best alignment is proposed.

Název v anglickém jazyce

Clustering of Protein Sequences

Popis výsledku anglicky

Clustering of protein sequences is one of the techniques that can be helpful for predicting secondary structure of protein. Clustering methods are based on expressing similarity or dissimilarity of such sequences. The similarity of two protein sequencescan be assessed by the score of the best alignment of the sequences. The paper deals with using formal model theory in describing this important task of bioinformatics. First, a well-known Needleman and Wunsch algorithm for finding the best alignment isintroduced. Then a finite automaton that can compute the score for the best alignment is proposed.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

JC - Počítačový hardware a software

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/GA102%2F05%2F0723" target="_blank" >GA102/05/0723: Rámec pro formální specifikace a prototypování síťových aplikací informačních systémů</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Proceedings of 1st International Workshop WFM'06

ISBN

80-86840-20-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

71-78

Název nakladatele

NEUVEDEN

Místo vydání

Přerov

Místo konání akce

Přerov

Datum konání akce

25. 4. 2006

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—