Real-time PCR detekce virů Blackcurrant reversion virus (BRV) a Gooseberry vein banding associated virus (GVBaV) v biologickém materiálu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F20%3AN0000048" target="_blank" >RIV/25271121:_____/20:N0000048 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Real-time PCR detekce virů Blackcurrant reversion virus (BRV) a Gooseberry vein banding associated virus (GVBaV) v biologickém materiálu

Popis výsledku v původním jazyce

Metodika se zaměřuje na zavedení nového detekčního systému pro rutinní diagnostiku rostlinných virů Blackcurrant reversion virus (BRV) a Gooseberry vein banding associated virus (GVBaV), které jsou původci virového onemocnění rybízu (Ribes spp.). BRV je původcem virového zvratu rybízu a GVBaV je původcem virového světlezeleného lemování žilek rybízu. Hostitelskými rostlinami těchto virů jsou zejména rybízy, avšak BRV byl popsán také u dalších příbuzných druhů. Virus GVBaV byl nalezen u angreštu (Ribes uva-crispa). Navržená metodika detekce virů je založena na principu real-time PCR. Tento přístup umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci obou virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován v multiplexním uspořádání pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu EPPO PM7/98(4) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu, dále pak pro využití ve virologických laboratořích v základním či aplikovaném výzkumu.

Název v anglickém jazyce

Real-time PCR detection of Blackcurrant reversion virus (BRV) and Gooseberry vein banding associated virus (GVBaV) in biological material

Popis výsledku anglicky

The aim of this method is to implement a new detection system for a routine diagnostics of plant viruses BRV and GVBaV. The host plants of these viruses are mainly currants, but the occurrence of BRV was also described in other related species. GVBaV was found also in gooseberries (Ribes uva-crispa). The detection method is based on real-time PCR; this approach allows simultaneous qualitative/quantitative detection of both viruses in one reaction. The detection system was validated in simplex and multiplex arrangements with the use of Rotor-Gene Q cycler (Qiagen) according to the validation scheme EPPO (European and Mediterranean Plant Protection Organization) PM7/98(4) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. The detection system may be preferably used for routine diagnostics of BRV and GVBaV during the certification procedure of propagation materials and for research purposes.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

<a href="/cs/project/TJ02000159" target="_blank" >TJ02000159: Vývoj a validace souprav pro diagnostiku vybraných rostlinných virů</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2020

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

978-80-87030-74-5

Číslo předpisu

UKZUZ 205304/2020

Technické parametry

Osvědčení pod č.j. UKZUZ 205304/2020 o uznání uplatněné certifikované metodiky vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský, Brno. Smlouva o využití výsledku uživatelem byla uzavřena s ÚKZÚZ.

Ekonomické parametry

Metodika zrychluje, zpřesňuje a zlevňuje diagnostiku virů BRV a GVBaV. Díky tomu mohou laboratoře zpracovat s vyšší citlivostí za stejný čas větší množství vzorků za nižší cenu, což např. sníží náklady na jednu analýzu, zvýší příjem z diagnostické činnosti nebo uvolní kapacitu laboratoře pro další testy. Rychlá odezva laboratoře bude mít pozitivní dopad na ekonomiku žadatele o vyšetření zdravotního stavu plodin, neboť může získat výsledky v kratším čase, a tak rychleji reagovat na výsledky. Záleží také na rozsahu nákazy a rychlosti odezvy laboratoře provádějící testy. Pozitivní dopad bude mít využití metodiky pro testování rozmnožovacího materiálu, kdy včasnou detekcí pozitivních rostlin bude zabráněno šíření virů množitelským materiálem a tím i ztrátám na výnosu v dalších letech.

Označení certifikačního orgánu

Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů