Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Complete genome sequence of cherry virus T, a novel cherry-infecting tepovirus

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F20%3AN0000120" target="_blank" >RIV/25271121:_____/20:N0000120 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/61989592:15310/20:73606527

  • Výsledek na webu

    <a href="https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00705-020-04656-w" target="_blank" >https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00705-020-04656-w</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1007/s00705-020-04656-w" target="_blank" >10.1007/s00705-020-04656-w</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Complete genome sequence of cherry virus T, a novel cherry-infecting tepovirus

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Double-stranded RNA and total RNA purified from sour cherry leaves (Prunus cerasus, cv. Amarelka Chvalkovicka) was analyzed by high-throughput sequencing. BLAST annotation identified contigs with homology to several already known cherry-infecting viruses (prune dwarf virus, prunus necrotic ringspot virus, prunus virus F, little cherry virus 1) as well as contigs with sequences more distantly related to those of members of the family Betaflexiviridae and in particular to prunus virus T of the genus Tepovirus. The full genome sequence of a putative virus (6,847 nucleotides [nt]; GenBank no. MT090966) was assembled and completed at the genome ends. The genome has a typical tepovirus organization, contain-ing three overlapping open reading frames (ORFs), encoding a replication-associated protein, a movement protein and a capsid protein, respectively. Both its genome organization and its phylogenetic relationships show that the virus belongs to the genus Tepovirus, but considering the species demarcation criteria for the family Betaflexiviridae, it appears to represent a novel virus species, and we propose the name “cherry virus T” (ChVT) for this virus.

  • Název v anglickém jazyce

    Complete genome sequence of cherry virus T, a novel cherry-infecting tepovirus

  • Popis výsledku anglicky

    Double-stranded RNA and total RNA purified from sour cherry leaves (Prunus cerasus, cv. Amarelka Chvalkovicka) was analyzed by high-throughput sequencing. BLAST annotation identified contigs with homology to several already known cherry-infecting viruses (prune dwarf virus, prunus necrotic ringspot virus, prunus virus F, little cherry virus 1) as well as contigs with sequences more distantly related to those of members of the family Betaflexiviridae and in particular to prunus virus T of the genus Tepovirus. The full genome sequence of a putative virus (6,847 nucleotides [nt]; GenBank no. MT090966) was assembled and completed at the genome ends. The genome has a typical tepovirus organization, contain-ing three overlapping open reading frames (ORFs), encoding a replication-associated protein, a movement protein and a capsid protein, respectively. Both its genome organization and its phylogenetic relationships show that the virus belongs to the genus Tepovirus, but considering the species demarcation criteria for the family Betaflexiviridae, it appears to represent a novel virus species, and we propose the name “cherry virus T” (ChVT) for this virus.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10607 - Virology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Archives of Virology

  • ISSN

    0304-8608

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    165

  • Číslo periodika v rámci svazku

    7

  • Stát vydavatele periodika

    AT - Rakouská republika

  • Počet stran výsledku

    4

  • Strana od-do

    1711-1714

  • Kód UT WoS článku

    000532887000003

  • EID výsledku v databázi Scopus