Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

First Report of Prunus virus F Infecting Sour Cherry in the Czech Republic

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F17%3AN0000119" target="_blank" >RIV/25271121:_____/17:N0000119 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-04-17-0469-PDN" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-04-17-0469-PDN</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1094/PDIS-04-17-0469-PDN" target="_blank" >10.1094/PDIS-04-17-0469-PDN</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    First Report of Prunus virus F Infecting Sour Cherry in the Czech Republic

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Prunus virus F (PrVF) is new tentative species in the genus Fabavirus, first described infecting stone fruits of temperate regions. It has recently been described in the complex of viruses causing sweet cherry tree decline in the U.S.A. During a survey for Prunus spp. viruses in the Czech Republic carried out in June 2008, three asymptomatic samples of sour cherry (P. cerasus) cv. Amarelka chvalkovicka were collected (among others) in a germplasm collection in Holovousy. CLC Genomics Workbench assembly of Illumina deep sequencing reads obtained from double-stranded RNAs isolated from leaves of these trees generated 21, 25, and 12 PrVF specific contigs totaling 7.38, 5.69, and 3.48 kb for each sample, respectively. The presence of PrVF in all three trees was confirmed by RT-PCR, in both the original and newly collected samples, using primers PrVF1F (5′-TTGTTATGGGCCTCGCTCTG-3′) and PrVF1R (5′-ATCAGTTTGAAGGGAAGGCCA-3′), PrVF2F (5′-CAAGCTTTYCTTGGYGCTTT-3′) and PrVF2R (5′-GAACACGCTGGGTCATYTCA-3′) for RNA1 and RNA2 detection. Amplicons were cloned into the pGEM-T Easy plasmid and three colonies were sequenced for each of them. To our knowledge, this is the first report of PrVF infecting sour cherry in the Czech Republic. Further efforts are needed to evaluate the prevalence of PrVF in cherry populations, its mode(s) of transmission, and its potential pathogenicity.

  • Název v anglickém jazyce

    First Report of Prunus virus F Infecting Sour Cherry in the Czech Republic

  • Popis výsledku anglicky

    Prunus virus F (PrVF) is new tentative species in the genus Fabavirus, first described infecting stone fruits of temperate regions. It has recently been described in the complex of viruses causing sweet cherry tree decline in the U.S.A. During a survey for Prunus spp. viruses in the Czech Republic carried out in June 2008, three asymptomatic samples of sour cherry (P. cerasus) cv. Amarelka chvalkovicka were collected (among others) in a germplasm collection in Holovousy. CLC Genomics Workbench assembly of Illumina deep sequencing reads obtained from double-stranded RNAs isolated from leaves of these trees generated 21, 25, and 12 PrVF specific contigs totaling 7.38, 5.69, and 3.48 kb for each sample, respectively. The presence of PrVF in all three trees was confirmed by RT-PCR, in both the original and newly collected samples, using primers PrVF1F (5′-TTGTTATGGGCCTCGCTCTG-3′) and PrVF1R (5′-ATCAGTTTGAAGGGAAGGCCA-3′), PrVF2F (5′-CAAGCTTTYCTTGGYGCTTT-3′) and PrVF2R (5′-GAACACGCTGGGTCATYTCA-3′) for RNA1 and RNA2 detection. Amplicons were cloned into the pGEM-T Easy plasmid and three colonies were sequenced for each of them. To our knowledge, this is the first report of PrVF infecting sour cherry in the Czech Republic. Further efforts are needed to evaluate the prevalence of PrVF in cherry populations, its mode(s) of transmission, and its potential pathogenicity.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LO1608" target="_blank" >LO1608: Výzkumné ovocnářské centrum</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2017

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Plant Disease

  • ISSN

    0191-2917

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    101

  • Číslo periodika v rámci svazku

    10

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    1

  • Strana od-do

    1828

  • Kód UT WoS článku

    000410877900039

  • EID výsledku v databázi Scopus