Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Variability Studies of Two Prunus-Infecting Fabaviruses with the Aid of High-Throughput Sequencing

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F18%3A00495082" target="_blank" >RIV/60077344:_____/18:00495082 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/v10040204" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.3390/v10040204</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/v10040204" target="_blank" >10.3390/v10040204</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Variability Studies of Two Prunus-Infecting Fabaviruses with the Aid of High-Throughput Sequencing

  • Popis výsledku v původním jazyce

    During their lifetime, perennial woody plants are expected to face multiple infection events. Furthermore, multiple genotypes of individual virus species may co-infect the same host. This may eventually lead to a situation where plants harbor complex communities of viral species/strains. Using high-throughput sequencing, we describe co-infection of sweet and sour cherry trees with diverse genomic variants of two closely related viruses, namely prunus virus F (PrVF) and cherry virus F (CVF). Both viruses are most homologous to members of the Fabavirus genus (Secoviridae family). The comparison of CVF and PrVF RNA2 genomic sequences suggests that the two viruses may significantly differ in their expression strategy. Indeed, similar to comoviruses, the smaller genomic segment of PrVF, RNA2, may be translated in two collinear proteins while CVF likely expresses only the shorter of these two proteins. Linked with the observation that identity levels between the coat proteins of these two viruses are significantly below the family species demarcation cut-off, these findings support the idea that CVF and PrVF represent two separate Fabavirus species.

  • Název v anglickém jazyce

    Variability Studies of Two Prunus-Infecting Fabaviruses with the Aid of High-Throughput Sequencing

  • Popis výsledku anglicky

    During their lifetime, perennial woody plants are expected to face multiple infection events. Furthermore, multiple genotypes of individual virus species may co-infect the same host. This may eventually lead to a situation where plants harbor complex communities of viral species/strains. Using high-throughput sequencing, we describe co-infection of sweet and sour cherry trees with diverse genomic variants of two closely related viruses, namely prunus virus F (PrVF) and cherry virus F (CVF). Both viruses are most homologous to members of the Fabavirus genus (Secoviridae family). The comparison of CVF and PrVF RNA2 genomic sequences suggests that the two viruses may significantly differ in their expression strategy. Indeed, similar to comoviruses, the smaller genomic segment of PrVF, RNA2, may be translated in two collinear proteins while CVF likely expresses only the shorter of these two proteins. Linked with the observation that identity levels between the coat proteins of these two viruses are significantly below the family species demarcation cut-off, these findings support the idea that CVF and PrVF represent two separate Fabavirus species.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10607 - Virology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LD15035" target="_blank" >LD15035: Jak využívat a interpretovat přebytek dat z paralelního sekvenování v rostlinné virologii?</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2018

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Viruses

  • ISSN

    1999-4915

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    10

  • Číslo periodika v rámci svazku

    4

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    13

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000435184400065

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85046092795