Real-time PCR detekce virů black raspberry necrosis virus (BRNV), raspberry ringspot virus (RpRSV), raspberry bushy dwarf virus (RBDV) a strawberry latent ringspot (SLRSV) v rostlinném materiálu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F22%3AN0000057" target="_blank" >RIV/25271121:_____/22:N0000057 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.vsuo.cz/images/patenty/Valentov_Metodika-RubusVir_2022.pdf" target="_blank" >https://www.vsuo.cz/images/patenty/Valentov_Metodika-RubusVir_2022.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Real-time PCR detekce virů black raspberry necrosis virus (BRNV), raspberry ringspot virus (RpRSV), raspberry bushy dwarf virus (RBDV) a strawberry latent ringspot (SLRSV) v rostlinném materiálu

Popis výsledku v původním jazyce

Cílem metodiky je poskytnout nový detekční systém pro rutinní diagnostiku rostlinných virů black raspberry necrosis virus (BRNV), raspberry ringspot virus (RpRSV), raspberry bushy dwarf virus (RBDV) a strawberry latent ringspot virus (SLRSV), původců virových onemocnění u rostlin rodu Rubus. Navržená metodika detekce virů je založena na principu multiplexní real-time PCR a umožňuje současnou kvalitativní/kvantitativní detekci všech čtyř virů v jedné reakci. Navržený detekční systém byl validován pro použití s cyklerem Rotor-Gene Q (Qiagen) dle validačního schématu obsaženého v EPPO PM 7/98 (5) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. Využití detekčního systému se předpokládá zejména pro rutinní diagnostiku těchto virů při certifikaci rozmnožovacího materiálu. Součástí metodiky je i porovnání diagnostických metod ELISA a nového detekčního systému pro viry RpRSV, RBDV a SLRSV, pro které jsou ELISA soupravy komerčně dostupné. Pro tyto viry lze diagnostický systém použít pro konfirmaci nálezů získaných metodou ELISA.

Název v anglickém jazyce

Real-time PCR detection of black raspberry necrosis virus (BRNV), raspberry ringspot virus (RpRSV), raspberry bushy dwarf virus (RBDV) a strawberry latent ringspot virus (SLRSV) in biological material

Popis výsledku anglicky

The aim of the methodology is to provide a new detection system for routine diagnosis of plant viruses black raspberry necrosis virus (BRNV), raspberry ringspot virus (RpRSV), raspberry bushy dwarf virus (RBDV) and strawberry latent ringspot virus (SLRSV), causal agents of viral diseases in plants of the genus Rubus. The proposed methodology for virus detection is based on the principle of multiplex real-time PCR and allows simultaneous qualitative/quantitative detection of all four viruses in one reaction. The proposed detection system has been validated for use with the Rotor-Gene Q cycler (Qiagen) according to the validation scheme contained in EPPO PM 7/98 (5) Specific requirements for laboratories preparing accreditation for a plant pest diagnostic activity. The use of the detection system is envisaged in particular for routine diagnosis of these viruses in the certification of propagating material. The methodology includes a comparison of ELISA diagnostic methods and the new detection system for RpRSV, RBDV and SLRSV for which ELISA kits are commercially available. For these viruses, the diagnostic system can be used to confirm the findings obtained by ELISA.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

<a href="/cs/project/TO01000295" target="_blank" >TO01000295: Zdravé ovoce v měnících se klimatických podmínkách: vývoj nových biotechnologických postupů diagnostiky virů, studium vektorů, ozdravování a bezpečného uchovávání jahodníku a maliníku</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

ISBN 978-80-87030-87-5

Číslo předpisu

UKZUZ 219681/2022

Technické parametry

Osvědčení pod č. UKZUZ 219681/2022 o uznání uplatněné certifikované metodiky vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský, Brno. Smlouva o využití výsledku uživatelem byla uzavřena s ÚKZÚZ.

Ekonomické parametry

Metodika zrychluje, zpřesňuje a zlevňuje diagnostiku virů BRNV, RpRSV, RBDV a SLRSV. Díky tomu mohou laboratoře zpracovat s vyšší citlivostí za stejný čas větší množství vzorků za nižší cenu, což např. sníží náklady na jednu analýzu, zvýší příjem z diagnostické činnosti nebo uvolní kapacitu laboratoře pro další testy. Rychlá odezva laboratoře bude mít pozitivní dopad na ekonomiku žadatele o vyšetření zdravotního stavu plodin, neboť může získat výsledky v kratším čase, a tak rychleji reagovat na výsledky. Záleží také na rozsahu nákazy a rychlosti odezvy laboratoře provádějící testy. Pozitivní dopad bude mít využití metodiky pro testování rozmnožovacího materiálu, kdy včasnou detekcí pozitivních rostlin bude zabráněno šíření virů množitelským materiálem a tím i ztrátám na výnosu v dalších letech.

Označení certifikačního orgánu

Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů