Genotypizace jabloně domácí (Malus × domestica Borkh.) pomocí SSR markerů v praxi

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F23%3AN0000079" target="_blank" >RIV/25271121:_____/23:N0000079 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Genotypizace jabloně domácí (Malus × domestica Borkh.) pomocí SSR markerů v praxi

Popis výsledku v původním jazyce

Jabloň domácí (Malus × domestica Borkh.) je významnou zemědělskou plodinou, která je pěstována po celém světě. Odhaduje se, že existuje více než 10 000 odrůd jabloní a mnoho šlechtitelských programů se stále zaměřuje na produkci nových kvalitnějších odrůd. Správné určení identity jednotlivých odrůd hraje důležitou roli ve všech úrovních produkce rostlinného materiálu, zvláště jedná-li se o práci s certifikovaným materiálem, a je nezbytné pro kontrolu deklarované odrůdové pravosti, např. při uznávacím řízení nových odrůd nebo při kontrolní činnosti. Rozlišení jednotlivých odrůd pomocí fenotypového a fenologického hodnocení, které se standardně provádí, může být jednak časově náročné, ale také obtížné a v některých případech, vzhledem k počtu existujících odrůd, dokonce nemožné. V dnešní době se proto přechází k určování odrůdy/genotypu (genotypování) pomocí molekulárních markerů molekulárně-biologickými metodami. Pro genotypování jabloní byla vyvinuta sada Ap17in1, která pomocí fragmentační analýzy detekuje 17 SSR (simple sequence repeats, krátké tandemové repetice) markerů v jedné reakci. Certifikovaná metodika poskytuje podrobný návod pro genotypizaci jabloní pomocí těchto markerů a předkládá její využití v praxi.

Název v anglickém jazyce

Genotyping of domestic apple (Malus × domestica Borkh.) using SSR markers in practice

Popis výsledku anglicky

Domestic apple (Malus × domestica Borkh.) is an important agricultural crop worldwide. It is estimated, that more than 10,000 cultivars of apples exist, and many breeding programs focus on producing new ones. The correct determination of identity of individual cultivars plays an important role at all levels of plant material production, especially working with certified materials. Declaring cultivar authenticity is necessary for e.g. recognition of new cultivars or for their verification. Distinguishing cultivars using phenotypic and phenological evaluation is a standard method but can be time-consuming and very difficult, and in some cases even impossible due to a high number of cultivars. Therefore, analysis of molecular markers is more and more popular nowadays for the determination of cultivar/genotype (genotyping). An Ap17in1 kit was developed for genotyping of apples, which detects 17 SSR (simple sequence repeats) markers in one reaction by the way of fragment analysis. This certified methodology provides detailed instructions for genotyping of apples using these markers and presents its use in practice.

Druh

N_metC - Metodiky certifikované oprávněným orgánem

CEP obor

—

OECD FORD obor

10608 - Biochemistry and molecular biology

Projekt

<a href="/cs/project/QK22010268" target="_blank" >QK22010268: Vývoj systémů pro genotypování ovocných plodin a jejich implementace do praxe</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2023

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

978-80-87030-90-5

Číslo předpisu

UKZUZ 145569/2023

Technické parametry

Osvědčení pod č.j. UKZUZ 145569/2023 o uznání metodiky v souladu s podmínkami Metodiky hodnocení výzkumných organizací a programů účelové podpory výzkumu, vývoje a inovací, schválené usnesením vlády dne 8. února 2017, číslo 107 a její samostatné přílohy č. 4 schválené usnesením vlády dne 29. listopadu 2017 č. 837 vydal Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědělský. Smlouva o využití výsledku uživatelem byla uzavřena s Ústředním kontrolním a zkušebním ústavem zemědělským se sídlem Hroznová 2, 656 06 Brno dne 20.7.2023.

Ekonomické parametry

Genotypizace materiálu pomocí SSR markerů je rychlá a efektivní metoda, která se provádí jen z malého vzorku materiálu a není pro ni potřeba plodící materiál. Výsledná cena genotypizace se proto předpokládá nižší než u klasických DUS zkoušek, kde dochází k dlouhodobému fenotypovému a fenologickému hodnocení plodícího materiálu. Navíc určení odrůdy na základě DUS testů není vždy zcela možné vzhledem k počtu existujících odrůd. Genotypizace je proto vhodná například k ověření pravosti odrůd před výsadbou či ke kontrole školkařského materiálu, kdy včasným odhalením možného pochybení může dojít k zamezení ztrát až v řádu statisíců korun (vztaženo k počtu materiálu potřebného na 1 hektar sadu).

Označení certifikačního orgánu

Ústřední kontrolní a zkušební ústav zemědelský, Hroznová 2, 656 06, Brno

Datum certifikace

—

Způsoby využití výsledku

C - Výsledek je využíván bez omezení okruhu uživatelů