Vývoj real-time PCR systému pro diagnostiku fytoplazem napadajících rostliny rodu Vaccinium

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25271121%3A_____%2F25%3AN0000152" target="_blank" >RIV/25271121:_____/25:N0000152 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Vývoj real-time PCR systému pro diagnostiku fytoplazem napadajících rostliny rodu Vaccinium

Popis výsledku v původním jazyce

Zdravý rozmnožovací materiál je nezbytný pro úspěšné pěstování rostlin rodu Vaccinium, kam spadají zejména brusnice chocholičnatá, která je oblíbená i mezi zahrádkáři. Dle certifikačního schématu se povinně sleduje přítomnost sedmi virů a čtyř fytoplazem (Candidatus Phytoplasma asteris, Candidatus Phytoplasma pruni, cranberry false blossom phytoplasma a Candidatus Phytoplasma solani). Porovnáním dostupných sekvencí genu pro 16S rRNA u uvedených fytoplazem byly vytipovány vhodné oblasti pro návrh primerů a sond pro detekční systém na bázi real-time PCR. Analýzy s využitím syntetických standardů prokázaly za daných podmínek 100% specificitu a analytickou senzitivitu na úrovni 50 kopií v reakci. Systémy byly úspěšně vyzkoušeny i u reálných izolátů příslušných fytoplazem.

Název v anglickém jazyce

Development of a real-time PCR system for the diagnostics of phytoplasmas infecting genus Vaccinium

Popis výsledku anglicky

Healthy propagating material is essential for the successful cultivation of plants of the genus Vaccinium, which includes especially the northern highbush blueberry, which is also popular among gardeners. According to the certification scheme, the presence of seven viruses and four phytoplasmas (Candidatus Phytoplasma asteris, Candidatus Phytoplasma pruni, cranberry false blossom phytoplasma and Candidatus Phytoplasma solani) is mandatorily monitored. By comparing the available sequences of 16S rRNA gene, suitable areas for the design of primers and probes for a real-time PCR-based phytoplasma detection system were selected. Analyses using synthetic standards demonstrated 100% specificity and analytical sensitivity at the level of 50 copies in the reaction under the given conditions. The systems have also been successfully tested with respective real phytoplasma isolates.

Druh

J_ost - Ostatní články v recenzovaných periodicích

CEP obor

—

OECD FORD obor

10607 - Virology

Projekt

<a href="/cs/project/QL24020033" target="_blank" >QL24020033: Vývoj diagnostických metod pro detekci patogenů rodu Vaccinium pro omezování jejich výskytu v množitelském materiálu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2025

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Úroda

ISSN

0139-6013

e-ISSN

—

Svazek periodika

73

Číslo periodika v rámci svazku

12

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

127-134

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—