Sada primerů k aplikaci CAPS a SBE markerů pro vybrané znaky kvality a odolnosti využitelné při šlechtění jarního ječmene

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F25328859%3A_____%2F22%3AN0000033" target="_blank" >RIV/25328859:_____/22:N0000033 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://isdv.upv.cz/webapp/resdb.print_detail.det?pspis=PUV/40258&plang=CS" target="_blank" >https://isdv.upv.cz/webapp/resdb.print_detail.det?pspis=PUV/40258&plang=CS</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Sada primerů k aplikaci CAPS a SBE markerů pro vybrané znaky kvality a odolnosti využitelné při šlechtění jarního ječmene

Popis výsledku v původním jazyce

Předmětem užitného vzoru je sada 16 PCR primerů pro detekci CAPS (Cleaved Amplified Polymorphic Sequence) a SBE (Single Base Extension) markerů asociovaných s vybranými znaky sladovnické kvality (α-amyláza, β-amyláza), nutriční kvality (beta-glukany) a pro detekci alel rezistence proti padlí u Hordeum vulgare L. (ječmen setý). Tato sada primerů zahrnuje 14 druhově specifických DNA sekvencí oligonukleotidů použitelných k amplifikaci fragmentů pomocí polymerázové řetězové reakce - PCR (Polymerase Chain Reaction). Cílové DNA fragmenty obsahují SNP (Single-Nucleotide Polymorphism) markery ve vazbě se znaky, jejichž alelické varianty mají statisticky průkazný efekt na obsah beta-glukanů, α-amylázy a β-amylázy a rezistence ječmene vůči padlí (mlo, a8 alela). SNP asociované s výše popsanými znaky byly vybrány na základě GWAS analýzy referenční populace 480 genotypů ječmene setého (Hordeum vulgare L.), obdobně jako v případě užitného vzoru CZ 34547 U1. Fyzická pozice fragmentů DNA amplifikovaných pomocí uvedených sad primerů je jednoznačně lokalizována na jednotlivých sekvencích chromozomů referenčního genomu.

Název v anglickém jazyce

Primers for applying CAPS and SBE markers for selected quality and resistance traits that can be used in spring barley breeding

Popis výsledku anglicky

The utility model is based on a set of 16 PCR primers for the detection of CAPS (Cleaved Amplified Polymorphic Sequence) and SBE (Single Base Extension) markers associated with selected traits of malting quality (α-amylase, β-amylase), nutritional quality (beta-glucans) and for detection of powdery mildew resistance alleles in Hordeum vulgare L. (barley). This set of primers includes 14 species-specific DNA sequences of oligonucleotides usable for amplification of fragments using polymerase chain reaction - PCR (Polymerase Chain Reaction). The target DNA fragments contain SNP (Single-Nucleotide Polymorphism) markers linked to traits whose allelic variants have a statistically significant effect on the content of beta-glucans, α-amylase and β-amylase and resistance of barley to powdery mildew (mlo, a8 allele). SNPs associated with the above-described traits were selected based on GWAS analysis of the reference population of 480 genotypes of barley (Hordeum vulgare L.), similarly to the case of the utility model CZ 34547 U1. The physical position of the DNA fragments amplified using the indicated primer sets is uniquely located on the individual chromosome sequences of the reference genome.

Druh

F_uzit - Užitný vzor

CEP obor

—

OECD FORD obor

40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Projekt

<a href="/cs/project/TN01000062" target="_blank" >TN01000062: Biotechnologické centrum pro genotypování rostlin</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2022

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Číslo patentu nebo vzoru

PUV 2022-40258

Vydavatel

CZ001 -

Název vydavatele

Industrial Property Office

Místo vydání

Prague

Stát vydání

CZ - Česká republika

Datum přijetí

—

Název vlastníka

Ústav experimentální botaniky AV ČR, Agrotest fyto, s.r.o., Výzkumný ústa v pivovarský a sladařskžý, a.s.

Způsob využití

A - Výsledek využívá pouze poskytovatel

Druh možnosti využití

P - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence