Současný stav v oblasti tekutých biopsií: technologie, klinický význam a hra čísel

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26475821%3A_____%2F16%3AN0000028" target="_blank" >RIV/26475821:_____/16:N0000028 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Současný stav v oblasti tekutých biopsií: technologie, klinický význam a hra čísel

Popis výsledku v původním jazyce

Prezentace na celostátní konferenci Dny molekulární patologie (Olomouc, 2016): Metodika molekulárního profilování volné nádorové DNA (cell-free tumor DNA, ctDNA), pro kterou se v posledních letech vžilo malebné označení tekutá biopsie (liquid biopsy), prošla dlouhým obdobím technologického vývoje. Od prvních zpráv o prosté detekci zvýšených hladin cirkulující DNA v krvi onkologických pacientů až po přechod k detekci ctDNA na základě záchytu nádorové specifických somatických mutací bylo společným jmenovatelem hledání vhodných metodických přístupů tak především i smysluplného využití tohoto postupu v klinické praxi. Z dnešního pohledu lze metodiky používané pro tekutou bipsii rozdělit na tzv. analogové a digitání. Postupy označované jako analogové bývají často založeny na formátu kvantitativní PCR (qPCR) v různých obměnách konkrétního provedení. Mezi nejznámější patří metody založené na alelicky-specifické PCR známé pod zkratkou ARMS (amplification-refractory mutation system), případně metody využívající amplifikaci s obohacením mutantní frakce na základě rozdílného stupně denaturace v průběhu templotního cyklování (Improved and Complete Enrichment CO-amplification at Lower Denaturation temperature, ICE-COLD). Společně s těmito se v poslední době stále více prosazují tzv. digitální přístupy, mezi které patří digitální PCR a hluboké sekvenování nové generace (deep next-generation sequencing, deep NGS).

Název v anglickém jazyce

Current situation of the art of liquid biopsies: technology, clinical significance and numbers

Popis výsledku anglicky

Presentation. The method of molecular proliferation of cell-free tumor DNA (ctDNA), for which the pictorial designation of liquid biopsy has come in recent years, has undergone a long period of technological development. From the first reports of simple detection of elevated levels of circulating DNA in the blood of oncological patients to the transition to ctDNA detection based on the capture of tumor-specific somatic mutations, the common denominator was to find appropriate methodical approaches and, above all, to make meaningful use of this practice in clinical practice. From today's perspective, the methodology used for liquid bipsia can be divided into so-called analog and digitization. Processes referred to as analogs are often based on quantitative PCR (qPCR) format in various variations of a particular embodiment. The most well-known methods include allelic-specific PCR based methods known as ARMS (amplification-refractory mutation system), or amplification methods using enriched mutant fractions based on Differential Enrichment Co-amplification at Lower Denaturation Temperature, ICE-COLD). Together with these, digital approaches such as digital PCR and deep next-generation sequencing (deep NGS)

Druh

A - Audiovizuální tvorba

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/NV15-27939A" target="_blank" >NV15-27939A: Přínos nové technologie „liquid biopsy“ pro monitoraci komplexní léčby kolorektálního karcinomu ve 3.- 4. stádiu onemocnění</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

ISBN

—

Místo vydání

Olomouc, CR

Název nakladatele resp. objednatele

—

Verze

—

Identifikační číslo nosiče

—