Využití MALDI-TOF MS pro identifikaci bakterií způsobujících kažení mlékárenských výrobků

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26722861%3A_____%2F18%3AN0000065" target="_blank" >RIV/26722861:_____/18:N0000065 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/60461373:22330/18:43917529 RIV/60461373:22810/18:43917529

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Využití MALDI-TOF MS pro identifikaci bakterií způsobujících kažení mlékárenských výrobků

Popis výsledku v původním jazyce

Metoda MALDI-TOF MS (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry, hmotnostní spektrometrie proteinů pomocí laserové desorpce/ionizace za účasti matrice s analyzátorem doby průletu) je rychlou a moderní metodou identifikace mikroorganismů, zvláště pak bakterií. V této práci byla provedena MALDI-TOF MS identifikace celkem 711 bakteriálních izolátů z mlékárenských výrobků a provozoven. Celkem 91 % izolátů bylo spolehlivě identifikováno na alespoň rodové úrovni. Úroveň spolehlivosti rodové a druhové identifikace ovlivňuje nejen výběr vhodné metody přípravy vzorku pro danou taxonomickou skupinu, ale i fylogenetické vztahy v rámci rodů a přítomnost odpovídajících proteinových profilů v referenční databázi. Druhová identifikace je poté více náročná pro jednotlivé druhy druhových skupin (např. Bacillus cereus group, Enterobacter cloacae komplex, druhové skupiny Pseudomonas spp.). Bylo zjištěno, že databáze Biotyper 3.1 (Bruker Daltonics, Německo) rodově i druhově dostatečně pokrývá běžnou bakteriální mikroflóru mlékárenských výrobků, kdy s využitím této databáze byly metodou MALDI-TOF MS identifikovány bakteriální izoláty patřící do celkem 39 rodů.

Název v anglickém jazyce

Application of MALDI-TOF MS for the identification of bacteria causing spoilage of dairy products

Popis výsledku anglicky

The identification of bacteria belongs to important operations in laboratory microbiological practice in diary industry. The MALDI-TOF MS (Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time-of-Flight Mass Spectrometry) method is a rapid and reliable method for microorganisms identification, specially for the identification of bacteria. In this work it was performed MALDI-TOF MS identification of totally 711 bacterial isolates from dairy products and dairy plants. In sum 91 % isolates was identified reliably at least on the genus level. The reliability level of the genus and species identification is influenced not only by the choice of an appropriate method for sample preparation, but also by the phylogenetic relations within the genera scope and by the presence of accordant proteins profiles in the reference database. The species identification is then more fastidious for single species in the species groups (e.g. the Bacillus cereus group, the Enterobacter cloacae complex, the Pseudomonas spp. species groups). It was also found, that the Biotyper 3.1 database (Bruker Daltonics, Germany) covers sufficiently the common bacterial microflora of dairy products, when by use this database and the MALDI-TOF MS method they were identified bacterial isolates totally ranking into 39 genera.

Druh

J_ost - Ostatní články v recenzovaných periodicích

CEP obor

—

OECD FORD obor

10606 - Microbiology

Projekt

<a href="/cs/project/QJ1210300" target="_blank" >QJ1210300: Systémy jištění kvality a bezpečnosti mlékárenských výrobků vhodnými metodami aplikovatelnými v praxi</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2018

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Mlékařské listy – zpravodaj

ISSN

1212-950X

e-ISSN

—

Svazek periodika

29

Číslo periodika v rámci svazku

6

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

25-31

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—