Sportčip

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F26739488%3A_____%2F20%3AN0000002" target="_blank" >RIV/26739488:_____/20:N0000002 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Sportčip

Popis výsledku v původním jazyce

Podstata technického řešení SportČipu spočívá v návrhu a výrobě nového typu microarray s kvantitativním spektroskopickým stanovením fluorescence. Principem je interakce krátkých vybraných úseků DNA, které jsou imobilizovány na aktivované matrici s jejich komplementárními fluorescenčně značenými sondami a detekují vybrané SNP.

Název v anglickém jazyce

SportChip

Popis výsledku anglicky

The essence of SportČip's technical solution lies in the design and production of a new type of microarray with quantitative fluorescence spectroscopic determination. The principle is the interaction of short selected sections of DNA that are immobilized on an activated matrix with their complementary fluorescently labeled probes and detect selected SNPs.

Druh

G_prot - Prototyp

CEP obor

—

OECD FORD obor

30306 - Sport and fitness sciences

Projekt

<a href="/cs/project/FV30421" target="_blank" >FV30421: GENOMKIT - Progresivní technologie pro racionalizaci personalizované farmakogenomiky, nutrigenomiky a sportovní medicíny</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2020

Kód důvěrnosti údajů

C - Předmět řešení projektu podléhá obchodnímu tajemství (§ 504 Občanského zákoníku), ale název projektu, cíle projektu a u ukončeného nebo zastaveného projektu zhodnocení výsledku řešení projektu (údaje P03, P04, P15, P19, P29, PN8) dodané do CEP, jsou upraveny tak, aby byly zveřejnitelné.

Interní identifikační kód produktu

FV30421003

Číselná identifikace

—

Technické parametry

Podstata technického řešení SportČipu spočívá v návrhu a výrobě nového typu microarray s kvantitativním spektroskopickým stanovením fluorescence. Principem je interakce krátkých vybraných úseků DNA, které jsou imobilizovány na aktivované matrici s jejich komplementárními fluorescenčně značenými sondami a detekují vybrané SNP. Prototyp je tvořen aktivovanou matricí pro imobilizaci DNA 25x75mm, 255 sekvencí genů relevantních pro sportovní genomiku a kontrolní sekvence pro microarray je reprezentováno imobilizovanými krátkými úseky DNA. Ten byl vytvořen použitím tiskového robotu NanoPrint™ (Arrayit) s použitím tiskové hlavy a pinů SMP3 (Telechem). Geometrie rozmístění spotů na čipu může být značně rozdílná v závislosti na počtu zvolených sekvencí, pro výtisk tohoto vzorku bylo použito rozmístění do 2 sub polí 600 μm od sebe vzdálených po 8 blocích, v každém bloku jsou spoty 10x10 s mezerou 375 μm a každý loci a kontroly jsou vytištěny v pěti opakováních v podobě spotu o průměru přibližně 100 μm (možná variabilita), včetně míst pro přidání nových sond. Výše zmíněné parametry microarray a dále informace k identifikaci pozic jednotlivých vzorků na substrátu jsou obsaženy v tzv. GAL souboru (obr.1 a 2). Po výtisku je microarray podroben kontrole kvality a následně hybridizován se sondami (2-2,5 μl/cm2) pocházejícími ze vzorků DNA jednotlivců a to při optimalizované teplotě. Vyhodnocení probíhá pomocí fluorescenčního skeneru (v našem případě GenePix® 4000B (Molecular Devices) pouze v zeleném detekčním kanálu (λ=532nm)). DNA sekvence pro výtisk byly připraveny o koncentraci 0,1-1 μg/ μl, kontroly o koncentraci 1-50 μM. Z intenzity signálu byly určeny koeficienty pro genotypy odpovídající homo/heterozygotnosti pro dané SNP. Obrázek 1:

Ekonomické parametry

Poslední genomické poznatky a technologie poskytují nástroje ke zefektivnění doporučení sportovcům na základě genomických znalostí na populační úrovni. Současné výsledky a zkušenosti s využíváním genomických nástrojů, DNA markerů, zejména jedno-nukleotidových polymorfismů, a konstrukce multimarkerových DNA čipů může přinést akceleraci sportovních výkonů dle jejich individuálního genomického profilu určeného na základě genotypizace, nebo určení predispozice k jednotlivým typům sportu. Použitím nového čipu budou stávající technologické postupy významně modernizovány a zefektivněny. Vysokokapacitní genomický screening představuje velmi slibný a užitečný nástroj ke stanovení a efektivní analýzu markerů statisticky významných na úrovni populací. Jedním z možných přístupů je právě využití microarrays (čipů).

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

26739488

Název vlastníka

MEDIWARE a.s.

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

V - Výsledek je využíván vlastníkem

Požadavek na licenční poplatek

A - Poskytovatel licence na výsledek požaduje licenční poplatek

Adresa www stránky s výsledkem

—