Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F44555601%3A13440%2F16%3A43887623" target="_blank" >RIV/44555601:13440/16:43887623 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://www.biopolymers.org.ua/pdf/32/1/070/biopolym.cell-2016-32-1-070-en.pdf" target="_blank" >http://www.biopolymers.org.ua/pdf/32/1/070/biopolym.cell-2016-32-1-070-en.pdf</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.7124/bc.00090F" target="_blank" >10.7124/bc.00090F</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The article is dedicated to optimization of the DNA microarray data processing, which is aimed at improving the quality of object clustering. Methods. Data preprocessing was performed with program R using Bioconductor package. Modelling the clustering process was made in the software environment KNIME using the program WEKA functions. Results. The data preprocessing is shown to be optimal while using such techniques as the background correction rma method, quantile normalization, mas PM correction and summarization by mas method. The simulation results have demonstrated a high effectiveness of the clustering algorithm Sota for this category of data. Conclusion. Improvement of the quality of biological object clustering is possible by means of hybridization and optimization of the methods and algorithms at different stages of data processing.

  • Název v anglickém jazyce

    Computational analysis of microarray gene expression profiles of lung cancer

  • Popis výsledku anglicky

    The article is dedicated to optimization of the DNA microarray data processing, which is aimed at improving the quality of object clustering. Methods. Data preprocessing was performed with program R using Bioconductor package. Modelling the clustering process was made in the software environment KNIME using the program WEKA functions. Results. The data preprocessing is shown to be optimal while using such techniques as the background correction rma method, quantile normalization, mas PM correction and summarization by mas method. The simulation results have demonstrated a high effectiveness of the clustering algorithm Sota for this category of data. Conclusion. Improvement of the quality of biological object clustering is possible by means of hybridization and optimization of the methods and algorithms at different stages of data processing.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    IN - Informatika

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    N - Vyzkumna aktivita podporovana z neverejnych zdroju

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2016

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Biopolymers and Cell

  • ISSN

    0233-7657

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    2016

  • Číslo periodika v rámci svazku

    Vol. 32. N 1.

  • Stát vydavatele periodika

    UA - Ukrajina

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    70-79

  • Kód UT WoS článku

  • EID výsledku v databázi Scopus