Řízená evoluce boolovských genetických obvodů v bakteriích

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F47813059%3A19240%2F14%3A%230005319" target="_blank" >RIV/47813059:19240/14:#0005319 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Řízená evoluce boolovských genetických obvodů v bakteriích

Popis výsledku v původním jazyce

Úspěch syntetické biologie závisí na možnosti efektivně sestavovat robustní genetické obvody. Sestavení byť i nejjednodušších genetických součástek (přepínače, logická hradla) je však stále ještě poměrně komplikované a vyžaduje intenzivní laboratorní práci. S nárůstem složitosti biologických obvodů se tento přístup stává neefektivním, jelikož závisí na mnohačetném opakování experimentů stylem pokus-omyl. Jedním z důvodů, proč je nutné experimenty mnohokrát opakovat je ten, že jednotlivé součástky v komplexním prostředí vzájemně interagují nepředvídatelným způsobem. Proto také narůstá popularita řízené evoluce založené na screeningu / selekci náhodných rekombinací knihoven genetických obvodů. V tomto článku využíváme techniku zvanou duální selekce. Pomocí této techniky, s využitím párů toxin-antitoxin a konjugační bílkoviny relaxázy, navrhujeme autonomní in vivo evoluční protokol pro selekci jednoduchých booleovských obvodů v bakteriích E. Coli. Oproti ostatním evolučním protokolům tent

Název v anglickém jazyce

Controlled Evolution of Boolean Genetic Circuits in Bacteria

Popis výsledku anglicky

We describe a synthetic biology framework for controlled bacterial evolution based on HGT, resulting in a direct biological implementation of an evolutionary algorithm. The necessary logic inside plasmids is based on the interplay of promoters and transcription factors. An output of these logic circuits will be a relaxase protein allowing the combinations of plasmids with good fitness to proliferate in the population. In silico experiments performed by our original individual-based bacterial simulator provide data to estimate the evolutionary and search capability of the plasmid-based engineered evolution.

Druh

C - Kapitola v odborné knize

CEP obor

IN - Informatika

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/ED1.1.00%2F02.0070" target="_blank" >ED1.1.00/02.0070: Centrum excelence IT4Innovations</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2014

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název knihy nebo sborníku

Kognitivní věda a umělý život II

ISBN

978-80-7248-951-0

Počet stran výsledku

7

Strana od-do

7-14

Počet stran knihy

231

Název nakladatele

Slezská univerzita v Opavě

Místo vydání

Opava

Kód UT WoS kapitoly

—