Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Exit regions of cavities in proteins

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F49777513%3A23520%2F19%3A43956381" target="_blank" >RIV/49777513:23520/19:43956381 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1109/BIBE.2019.00010" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1109/BIBE.2019.00010</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1109/BIBE.2019.00010" target="_blank" >10.1109/BIBE.2019.00010</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Exit regions of cavities in proteins

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Proteins have a complex three dimensional structure with empty cavities and tunnels in the inter-atomic space and these spatial features are often essential for the correct biological function. Many discrete and analytical methods have been developed for the computation, analysis and visualization of these features. In this paper, we focus on the connection of cavities with the space outside a protein. This connection would normally be described by tunnels. However, the number of possible solutions can be very high and therefore a nontrivial pruning of solutions is needed to deliver only a few representatives. Therefore, we propose an alternative kind of spatial features called exit regions of cavities. These regions capture the critical locations where a spherical probe, initially placed in a cavity, can leave the protein if the probe is allowed to shrink. The shape of an exit region is more detailed when compared against the simple circular profile of a tunnel. Tunnels, on the other hand, provide more information about the exact path.

  • Název v anglickém jazyce

    Exit regions of cavities in proteins

  • Popis výsledku anglicky

    Proteins have a complex three dimensional structure with empty cavities and tunnels in the inter-atomic space and these spatial features are often essential for the correct biological function. Many discrete and analytical methods have been developed for the computation, analysis and visualization of these features. In this paper, we focus on the connection of cavities with the space outside a protein. This connection would normally be described by tunnels. However, the number of possible solutions can be very high and therefore a nontrivial pruning of solutions is needed to deliver only a few representatives. Therefore, we propose an alternative kind of spatial features called exit regions of cavities. These regions capture the critical locations where a spherical probe, initially placed in a cavity, can leave the protein if the probe is allowed to shrink. The shape of an exit region is more detailed when compared against the simple circular profile of a tunnel. Tunnels, on the other hand, provide more information about the exact path.

Klasifikace

  • Druh

    D - Stať ve sborníku

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název statě ve sborníku

    2019 IEEE 19th International Conference on Bioinformatics and Bioengineering

  • ISBN

    978-1-72814-617-1

  • ISSN

    2471-7819

  • e-ISSN

  • Počet stran výsledku

    6

  • Strana od-do

    1-6

  • Název nakladatele

    IEEE

  • Místo vydání

    Piscataway

  • Místo konání akce

    Atheny

  • Datum konání akce

    28. 10. 2019

  • Typ akce podle státní příslušnosti

    WRD - Celosvětová akce

  • Kód UT WoS článku