KEC: unique sequence search by K-mer exclusion

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12220%2F21%3A43902873" target="_blank" >RIV/60076658:12220/21:43902873 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://academic.oup.com/bioinformatics/article/37/19/3349/6182676?login=true" target="_blank" >https://academic.oup.com/bioinformatics/article/37/19/3349/6182676?login=true</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btab196" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/btab196</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

KEC: unique sequence search by K-mer exclusion

Popis výsledku v původním jazyce

Searching for amino acid or nucleic acid sequences unique to one organism may be challenging depending on size of the available datasets. K-mer elimination by cross-reference (KEC) allows users to quickly and easily find unique sequences by providing target and non-target sequences. Due to its speed, it can be used for datasets of genomic size and can be run on desktop or laptop computers with modest specifications.

Název v anglickém jazyce

KEC: unique sequence search by K-mer exclusion

Popis výsledku anglicky

Searching for amino acid or nucleic acid sequences unique to one organism may be challenging depending on size of the available datasets. K-mer elimination by cross-reference (KEC) allows users to quickly and easily find unique sequences by providing target and non-target sequences. Due to its speed, it can be used for datasets of genomic size and can be run on desktop or laptop computers with modest specifications.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology

Projekt

<a href="/cs/project/LTC19014" target="_blank" >LTC19014: Detekce xantomonád způsobujících onemocnění rajčete pomocí metody loop-mediated isothermal amplification</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2021

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Bioinformatics

ISSN

1367-4803

e-ISSN

—

Svazek periodika

37

Číslo periodika v rámci svazku

19

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

2

Strana od-do

3349-3350

Kód UT WoS článku

000733827400034

EID výsledku v databázi Scopus

—