Studium elementů struktury vlásenky IV telomerázové RNA z Tetrahymeny důležitých pro funkci.
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12310%2F06%3A00008791" target="_blank" >RIV/60076658:12310/06:00008791 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Structural study of elements of Tetrahymena telomerase RNA stem-loop IV domain important for function
Popis výsledku v původním jazyce
Tetrahymena telomerase RNA (TER) contains several regions in addition to the template that are important for function. Central among these is the stem-loop IV domain, which is involved in both catalysis and RNP assembly, and includes binding sites for both the holoenzyme assembly protein p65 and telomerase reverse transcriptase (TERT). Stem-loop IV contains two regions with high evolutionary sequence conservation: a central GA bulge between helices, and a terminal loop. We solved the solution structureof loop IV and modeled the structure of the helical region containing the GA bulge, using NMR and residual dipolar couplings. The central GA bulge with flanking C-G base pairs induces a 50° semi-rigid bend in the helix. Loop IV is highly structured, andcontains a conserved C-U base pair at the top of the helical stem. Analysis of new and previous biochemical data in light of the structure provides a rationale for some of the sequence conservation in this region of TER. The results sugge
Název v anglickém jazyce
Structural study of elements of Tetrahymena telomerase RNA stem-loop IV domain important for function
Popis výsledku anglicky
Tetrahymena telomerase RNA (TER) contains several regions in addition to the template that are important for function. Central among these is the stem-loop IV domain, which is involved in both catalysis and RNP assembly, and includes binding sites for both the holoenzyme assembly protein p65 and telomerase reverse transcriptase (TERT). Stem-loop IV contains two regions with high evolutionary sequence conservation: a central GA bulge between helices, and a terminal loop. We solved the solution structureof loop IV and modeled the structure of the helical region containing the GA bulge, using NMR and residual dipolar couplings. The central GA bulge with flanking C-G base pairs induces a 50° semi-rigid bend in the helix. Loop IV is highly structured, andcontains a conserved C-U base pair at the top of the helical stem. Analysis of new and previous biochemical data in light of the structure provides a rationale for some of the sequence conservation in this region of TER. The results sugge
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju
Ostatní
Rok uplatnění
2006
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
RNA-A Publication of the RNA Society
ISSN
1355-8382
e-ISSN
—
Svazek periodika
12
Číslo periodika v rámci svazku
8
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
1475-1485
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—