Arabidopsis Gene Family Profiler (aGFP) - uživatelsky orientovaná transkriptomická databáze s přehledným grafickým rozhraním

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12310%2F07%3A00008814" target="_blank" >RIV/60076658:12310/07:00008814 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Arabidopsis Gene Family Profiler (aGFP)--user-oriented transcriptomic database with easy-to-use graphic interface.

Popis výsledku v původním jazyce

Microarray technologies now belong to the standard functional genomics toolbox and have undergone massive development leading to increased genome coverage, accuracy and reliability. The number of experiments exploiting microarray technology has markedlyincreased in recent years followed by rapid accumulation of transcriptomic data. Global statistical data analysis methods contribute to the development of overall concepts about gene expression patterns and to query and compose working hypotheses. We present a curated gene family-oriented gene expression database, Arabidopsis Gene Family Profiler (aGFP; http://agfp.ueb.cas.cz), which gives the user access to a large collection of normalised Affymetrix ATH1 microarray datasets. The database currently contains NASC Array and AtGenExpress transcriptomic datasets for various tissues at different developmental stages of wild type plants gathered from nearly 350 gene chips.

Název v anglickém jazyce

Arabidopsis Gene Family Profiler (aGFP)--user-oriented transcriptomic database with easy-to-use graphic interface.

Popis výsledku anglicky

Microarray technologies now belong to the standard functional genomics toolbox and have undergone massive development leading to increased genome coverage, accuracy and reliability. The number of experiments exploiting microarray technology has markedlyincreased in recent years followed by rapid accumulation of transcriptomic data. Global statistical data analysis methods contribute to the development of overall concepts about gene expression patterns and to query and compose working hypotheses. We present a curated gene family-oriented gene expression database, Arabidopsis Gene Family Profiler (aGFP; http://agfp.ueb.cas.cz), which gives the user access to a large collection of normalised Affymetrix ATH1 microarray datasets. The database currently contains NASC Array and AtGenExpress transcriptomic datasets for various tissues at different developmental stages of wild type plants gathered from nearly 350 gene chips.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju

Rok uplatnění

2007

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Plant Biology

ISSN

1435-8603

e-ISSN

—

Svazek periodika

7

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

1

Strana od-do

39

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—