The complete chloroplast genome sequence of Dactylorhiza majalis (Rchb.) PF Hunt et Summerh. (Orchidaceae)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12310%2F19%3A43899567" target="_blank" >RIV/60076658:12310/19:43899567 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://www.tandfonline.com/doi/pdf/10.1080/23802359.2019.1660282?needAccess=true" target="_blank" >https://www.tandfonline.com/doi/pdf/10.1080/23802359.2019.1660282?needAccess=true</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1080/23802359.2019.1660282" target="_blank" >10.1080/23802359.2019.1660282</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
The complete chloroplast genome sequence of Dactylorhiza majalis (Rchb.) PF Hunt et Summerh. (Orchidaceae)
Popis výsledku v původním jazyce
The complete chloroplast genome of Dactylorhiza majalis (Rchb.) P.F. Hunt et Summerh. (Orchidaceae:Orchidoideae) was assembled and characterized using next-generation sequencing data. The plastome (154,108 bp) possesses the typical circular structure consisting of a large single-copy region (LSC; 83,196 bp), a small single-copy region (SSC; 26,580 bp), and two copies of inverted repeats (17,752 bp each). Its overall GC content is 36.99% and the plastome encodes 134 genes. Reconstruction of phylogenetic relationships using complete plastome sequences of Orchidaceae representatives showed that D. majalis was nested within the Orchidoideae tribe Orchideae. The complete plastome comprises a valuable tool in elucidating taxonomic uncertainties within the genus Dactylorhiza.
Název v anglickém jazyce
The complete chloroplast genome sequence of Dactylorhiza majalis (Rchb.) PF Hunt et Summerh. (Orchidaceae)
Popis výsledku anglicky
The complete chloroplast genome of Dactylorhiza majalis (Rchb.) P.F. Hunt et Summerh. (Orchidaceae:Orchidoideae) was assembled and characterized using next-generation sequencing data. The plastome (154,108 bp) possesses the typical circular structure consisting of a large single-copy region (LSC; 83,196 bp), a small single-copy region (SSC; 26,580 bp), and two copies of inverted repeats (17,752 bp each). Its overall GC content is 36.99% and the plastome encodes 134 genes. Reconstruction of phylogenetic relationships using complete plastome sequences of Orchidaceae representatives showed that D. majalis was nested within the Orchidoideae tribe Orchideae. The complete plastome comprises a valuable tool in elucidating taxonomic uncertainties within the genus Dactylorhiza.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10611 - Plant sciences, botany
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2019
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Mitochondrial DNA Part B - Resources
ISSN
2380-2359
e-ISSN
—
Svazek periodika
4
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
3
Strana od-do
2821-2823
Kód UT WoS článku
000486535900001
EID výsledku v databázi Scopus
—