Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Stage-dependent differences in RNA composition and content affect the outcome of expression profiling in roach (Rutilus rutilus) ovary

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60076658%3A12520%2F11%3A43873477" target="_blank" >RIV/60076658:12520/11:43873477 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.cbpa.2011.02.007" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.cbpa.2011.02.007</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.cbpa.2011.02.007" target="_blank" >10.1016/j.cbpa.2011.02.007</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Stage-dependent differences in RNA composition and content affect the outcome of expression profiling in roach (Rutilus rutilus) ovary

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The influence of changing composition and content of RNA on the results of expression profiling was studied in the ovaries of roach (Rutilus rutilus). The highest total RNA yield was detected in the primary growth (pg) and early cortical alveolus (eca) stages. The total RNA yield gradually decreased through the late cortical alveolus and late vitellogenic stages. In the pg and eca stages, total RNA was characterized by a low percentage of 18S and 28S rRNA and a high content of smaller-sized RNAs, opposite pattern was observed in later stages. The ratio mRNA/total RNA was highest at the pg stage but decreased significantly in later stages. When total RNA was used for RT, the shift in the mRNA/total RNA ratio influenced the results of qPCR of four commonly used reference and two target genes (TG). Therefore, the expression of TG should be related to the mRNA pool using the same input of either mRNA to RT or cDNA to qPCR. Gene expression could be also related to tissue-specific RNA yield

  • Název v anglickém jazyce

    Stage-dependent differences in RNA composition and content affect the outcome of expression profiling in roach (Rutilus rutilus) ovary

  • Popis výsledku anglicky

    The influence of changing composition and content of RNA on the results of expression profiling was studied in the ovaries of roach (Rutilus rutilus). The highest total RNA yield was detected in the primary growth (pg) and early cortical alveolus (eca) stages. The total RNA yield gradually decreased through the late cortical alveolus and late vitellogenic stages. In the pg and eca stages, total RNA was characterized by a low percentage of 18S and 28S rRNA and a high content of smaller-sized RNAs, opposite pattern was observed in later stages. The ratio mRNA/total RNA was highest at the pg stage but decreased significantly in later stages. When total RNA was used for RT, the shift in the mRNA/total RNA ratio influenced the results of qPCR of four commonly used reference and two target genes (TG). Therefore, the expression of TG should be related to the mRNA pool using the same input of either mRNA to RT or cDNA to qPCR. Gene expression could be also related to tissue-specific RNA yield

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    EB - Genetika a molekulární biologie

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/ED2.1.00%2F01.0024" target="_blank" >ED2.1.00/01.0024: Jihočeské výzkumné centrum akvakultury a biodiverzity hydrocenóz</a><br>

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2011

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Comparative Biochemistry and Physiology A-Molecular & Integrative Physiology

  • ISSN

    1095-6433

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    159

  • Číslo periodika v rámci svazku

    2

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    141-149

  • Kód UT WoS článku

    000290195500006

  • EID výsledku v databázi Scopus