Spatial expression profiles in the Xenopus laevis oocytes measured with qPCR tomography
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F00216208%3A11310%2F10%3A10080983" target="_blank" >RIV/00216208:11310/10:10080983 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/86652036:_____/10:00346483
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Spatial expression profiles in the Xenopus laevis oocytes measured with qPCR tomography
Popis výsledku v původním jazyce
qPCR tomography was developed to study mRNA localization in complex biological samples that are embedded and cryo-sectioned. After total RNA extraction and reverse transcription, the spatial profiles of mRNAs and other functional RNAs were determined byqPCR. The Xenopus laevis oocyte was selected as model, because of its large size (more than 1 mm) and large amount of total RNA ( 5 mýg). Fifteen sections along the animal-vegetal axis were cut and prepared for quantification of 31 RNA targets using thehigh-throughput real-time RT-PCR (qPCR) BioMark? platform. mRNAs were found to have two localization patterns, animal/central or vegetal. Because of the high resolution in sectioning, it was possible to distinguish two subgroups of the vegetal gene patterns: germ plasm determinant pattern and profile of other vegetal genes.
Název v anglickém jazyce
Spatial expression profiles in the Xenopus laevis oocytes measured with qPCR tomography
Popis výsledku anglicky
qPCR tomography was developed to study mRNA localization in complex biological samples that are embedded and cryo-sectioned. After total RNA extraction and reverse transcription, the spatial profiles of mRNAs and other functional RNAs were determined byqPCR. The Xenopus laevis oocyte was selected as model, because of its large size (more than 1 mm) and large amount of total RNA ( 5 mýg). Fifteen sections along the animal-vegetal axis were cut and prepared for quantification of 31 RNA targets using thehigh-throughput real-time RT-PCR (qPCR) BioMark? platform. mRNAs were found to have two localization patterns, animal/central or vegetal. Because of the high resolution in sectioning, it was possible to distinguish two subgroups of the vegetal gene patterns: germ plasm determinant pattern and profile of other vegetal genes.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Methods
ISSN
1046-2023
e-ISSN
—
Svazek periodika
51
Číslo periodika v rámci svazku
1
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000277953300013
EID výsledku v databázi Scopus
—