Vnitrobuněčné expresní profily, měřené pomocí real-time PCR tomografie ve vajíčcích Xenopus laevis
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F08%3A00094683" target="_blank" >RIV/68378050:_____/08:00094683 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216208:11110/08:1892
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Intracellular expression profiles measured by real-time PCR tomography in the Xenopus laevis oocyte
Popis výsledku v původním jazyce
Real-time tomography is a novel quantitative method for measuring localized RNA-expression profiles within single cells. We show its usefulness by dissecting an X. laevis oocyte to slices along its animal?vegetal axis, extracting RNA and measuring levelsof 18 selected mRNAs by real-time RT-PCR. This identified 2 classes of mRNA, one preferentially located towards the animal, the other towards the vegetal pole. mRNAs in each group show comparable intracellular gradients, suggesting they are produced bysimilar mechanisms. Polarization is substantial, though not extreme,with ca 5% of vegetal gene mRNA molecules at the animal pole and ca 50% in the far most vegetal section. Most animal pole mRNAs were found in the 2nd section from the animal pole and inthe central section where the nucleus is located. mRNA expression profiles did not change after in vitro fertilization; we conclude that the post-fertilization cortical rotation has no detectable effect on intracellular mRNA gradients.
Název v anglickém jazyce
Intracellular expression profiles measured by real-time PCR tomography in the Xenopus laevis oocyte
Popis výsledku anglicky
Real-time tomography is a novel quantitative method for measuring localized RNA-expression profiles within single cells. We show its usefulness by dissecting an X. laevis oocyte to slices along its animal?vegetal axis, extracting RNA and measuring levelsof 18 selected mRNAs by real-time RT-PCR. This identified 2 classes of mRNA, one preferentially located towards the animal, the other towards the vegetal pole. mRNAs in each group show comparable intracellular gradients, suggesting they are produced bysimilar mechanisms. Polarization is substantial, though not extreme,with ca 5% of vegetal gene mRNA molecules at the animal pole and ca 50% in the far most vegetal section. Most animal pole mRNAs were found in the 2nd section from the animal pole and inthe central section where the nucleus is located. mRNA expression profiles did not change after in vitro fertilization; we conclude that the post-fertilization cortical rotation has no detectable effect on intracellular mRNA gradients.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/KJB500520601" target="_blank" >KJB500520601: Kvantifikace a lokalizace maternálních mRNA v časném vývoji drápatky (Xenopus)</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2008
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Nucleic Acids Research
ISSN
0305-1048
e-ISSN
—
Svazek periodika
36
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
6
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
00025302160
EID výsledku v databázi Scopus
—