Komplex Leishmania donovani: genotypy pěti metabolických enzymů (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), nových cílů multilokálního sekvenčního typování

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F07%3A00087493" target="_blank" >RIV/60077344:_____/07:00087493 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/60076658:12310/07:00008005

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

The Leishmania donovani complex: Genotypes of five metabolic enzymes (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), new targets for multilocus sequence typing

Popis výsledku v původním jazyce

The complex Leishmania donovani is comprised of L. donovani (LD), L. infantum (LI) and L. archibaldi (LA). Morphological distinction of species is impractical, so biochemical, immunological and DNA-based criteria were introduced. Multilocus enzyme electrophoresis (MLEE) is the present gold standard. We have sequenced the genes encoding 5 metabolic enzymes used for MLEE, both to resolve the DNA diversity underlying isoenzyme mobility differences and to explore the potential of these targets for higher resolution PCR-based multilocus sequence typing. The genes sequenced were isocitrate dehydrogenase, malic enzyme, mannose phosphate isomerase, glucose-6-phosphate dehydrogenase, and fumarate hydratase, for 17 LI strains, 7 LD strains , and 3 LA strains. Phylogenetic analysis of a concatenated alignment based on a total of 263 kb protein-coding sequences showed strong correlation of genotype with geographical origin. Europe and Africa appear to represent independent evolutionary centres.

Název v anglickém jazyce

The Leishmania donovani complex: Genotypes of five metabolic enzymes (ICD, ME, MPI, G6PDH and FH), new targets for multilocus sequence typing

Popis výsledku anglicky

The complex Leishmania donovani is comprised of L. donovani (LD), L. infantum (LI) and L. archibaldi (LA). Morphological distinction of species is impractical, so biochemical, immunological and DNA-based criteria were introduced. Multilocus enzyme electrophoresis (MLEE) is the present gold standard. We have sequenced the genes encoding 5 metabolic enzymes used for MLEE, both to resolve the DNA diversity underlying isoenzyme mobility differences and to explore the potential of these targets for higher resolution PCR-based multilocus sequence typing. The genes sequenced were isocitrate dehydrogenase, malic enzyme, mannose phosphate isomerase, glucose-6-phosphate dehydrogenase, and fumarate hydratase, for 17 LI strains, 7 LD strains , and 3 LA strains. Phylogenetic analysis of a concatenated alignment based on a total of 263 kb protein-coding sequences showed strong correlation of genotype with geographical origin. Europe and Africa appear to represent independent evolutionary centres.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/2B06129" target="_blank" >2B06129: MODELOVÉ ORGANISMY JAKO KLÍČ K POCHOPENÍ FUNKCE GENŮ NEZBYTNÝCH PRO ZDRAVÍ ČLOVĚKA</a><br>

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)<br>R - Projekt Ramcoveho programu EK

Rok uplatnění

2007

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

International Journal for Parasitology

ISSN

0020-7519

e-ISSN

—

Svazek periodika

37

Číslo periodika v rámci svazku

2

Stát vydavatele periodika

AU - Austrálie

Počet stran výsledku

12

Strana od-do

149-160

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—