Evaluating the Effects of the Nonplanarity of Nucleic Acid Bases on NMR, IR, and Vibrational Circular Dichroism Spectra: A Density Functional Theory Computational Study
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F10%3A00347407" target="_blank" >RIV/60077344:_____/10:00347407 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61388963:_____/10:00347407
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Evaluating the Effects of the Nonplanarity of Nucleic Acid Bases on NMR, IR, and Vibrational Circular Dichroism Spectra: A Density Functional Theory Computational Study
Popis výsledku v původním jazyce
The pyramidalizations of N9/1 glycosidic nitrogens in DNA and RNA nucleosides were found to have significant effects on the structural interpretation of the 3J(C4/2-H1) and 3J(C8/6-H1) NMR scalar couplings in purine/pyrimidine nucleosides. The calculatedstructural deforomations in nucleosides are depended on sugar-to-base orientation. The sign alternation of this correction in syn and anti nucleosides arises from the stereoinversion of the N9/1 glycosidic nitrogen occurring upon reorientation of the glycosidic torsion. Utilization of the calculated phase-shift corrections in the design of Karplus equations for the 3J couplings was suggested, and the effects on structural interpretation of the experimental couplings were evaluated. The calculated effects on IR and vibrational circular dichroism (VCD) spectra were only minor.
Název v anglickém jazyce
Evaluating the Effects of the Nonplanarity of Nucleic Acid Bases on NMR, IR, and Vibrational Circular Dichroism Spectra: A Density Functional Theory Computational Study
Popis výsledku anglicky
The pyramidalizations of N9/1 glycosidic nitrogens in DNA and RNA nucleosides were found to have significant effects on the structural interpretation of the 3J(C4/2-H1) and 3J(C8/6-H1) NMR scalar couplings in purine/pyrimidine nucleosides. The calculatedstructural deforomations in nucleosides are depended on sugar-to-base orientation. The sign alternation of this correction in syn and anti nucleosides arises from the stereoinversion of the N9/1 glycosidic nitrogen occurring upon reorientation of the glycosidic torsion. Utilization of the calculated phase-shift corrections in the design of Karplus equations for the 3J couplings was suggested, and the effects on structural interpretation of the experimental couplings were evaluated. The calculated effects on IR and vibrational circular dichroism (VCD) spectra were only minor.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Physical Chemistry A
ISSN
1089-5639
e-ISSN
—
Svazek periodika
114
Číslo periodika v rámci svazku
37
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
7
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000281753800030
EID výsledku v databázi Scopus
—