Diverse retrotransposon families and an AT-rich satellite DNA revealed in giant genomes of Fritillaria lilies

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F11%3A00359134" target="_blank" >RIV/60077344:_____/11:00359134 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14740/11:00049704

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Diverse retrotransposon families and an AT-rich satellite DNA revealed in giant genomes of Fritillaria lilies

Popis výsledku v původním jazyce

Background and Aims The genus Fritillaria (Liliaceae) comprises species with extremely large genomes (1C = 30 000-127 000 Mb) and a bicontinental distribution. Most North American species (subgenus Liliorhiza) differ from Eurasian Fritillaria species bytheir distinct phylogenetic position and increased amounts of heterochromatin. This study examined the contribution of major repetitive elements to the genome obesity found in Fritillaria and identified repeats contributing to the heterochromatin arraysin Liliorhiza species. Methods Two Fritillaria species of similar genome size were selected for detailed analysis, one from each phylogeographical clade: F. affinis (1C = 45.6 pg, North America) and F. imperialis (1C = 43.0 pg, Eurasia). Fosmid librarieswere constructed from their genomic DNAs and used for identification, sequence characterization, quantification and chromosome localization of clones containing highly repeated sequences.

Název v anglickém jazyce

Diverse retrotransposon families and an AT-rich satellite DNA revealed in giant genomes of Fritillaria lilies

Popis výsledku anglicky

Background and Aims The genus Fritillaria (Liliaceae) comprises species with extremely large genomes (1C = 30 000-127 000 Mb) and a bicontinental distribution. Most North American species (subgenus Liliorhiza) differ from Eurasian Fritillaria species bytheir distinct phylogenetic position and increased amounts of heterochromatin. This study examined the contribution of major repetitive elements to the genome obesity found in Fritillaria and identified repeats contributing to the heterochromatin arraysin Liliorhiza species. Methods Two Fritillaria species of similar genome size were selected for detailed analysis, one from each phylogeographical clade: F. affinis (1C = 45.6 pg, North America) and F. imperialis (1C = 43.0 pg, Eurasia). Fosmid librarieswere constructed from their genomic DNAs and used for identification, sequence characterization, quantification and chromosome localization of clones containing highly repeated sequences.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2011

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Annals of Botany

ISSN

0305-7364

e-ISSN

—

Svazek periodika

107

Číslo periodika v rámci svazku

2

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

14

Strana od-do

—

Kód UT WoS článku

000286672500007

EID výsledku v databázi Scopus

—