Molecular phylogeography of tick-borne encephalitis virus in central Europe
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F13%3A00421268" target="_blank" >RIV/60077344:_____/13:00421268 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00027162:_____/13:#0001044
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1099/vir.0.054478-0" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1099/vir.0.054478-0</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1099/vir.0.054478-0" target="_blank" >10.1099/vir.0.054478-0</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Molecular phylogeography of tick-borne encephalitis virus in central Europe
Popis výsledku v původním jazyce
In order to obtain a better understanding of tick-borne encephalitis virus (TBEV) strain movements in central Europe the E gene sequences of 102 TBEV strains collected from 1953 to 2011 at 38 sites in the Czech Republic, Slovakia, Austria and Germany were determined. Bayesian analysis suggests a 350-year history of evolution and spread in central Europe of two main lineages, A and B. In contrast to the east to west spread at the Eurasian continent level, local central European spreading patterns suggesthistoric west to east spread followed by more recent east to west spread. The phylogenetic and network analyses indicate TBEV ingressions from the Czech Republic and Slovakia into Germany via landscape features (Danube river system), biogenic factors (birds, red deer) and anthropogenic factors. The identification of endemic foci showing local genetic diversity is of paramount importance to the field as these will be a prerequisite for in-depth analysis of focal TBEV maintenance and long
Název v anglickém jazyce
Molecular phylogeography of tick-borne encephalitis virus in central Europe
Popis výsledku anglicky
In order to obtain a better understanding of tick-borne encephalitis virus (TBEV) strain movements in central Europe the E gene sequences of 102 TBEV strains collected from 1953 to 2011 at 38 sites in the Czech Republic, Slovakia, Austria and Germany were determined. Bayesian analysis suggests a 350-year history of evolution and spread in central Europe of two main lineages, A and B. In contrast to the east to west spread at the Eurasian continent level, local central European spreading patterns suggesthistoric west to east spread followed by more recent east to west spread. The phylogenetic and network analyses indicate TBEV ingressions from the Czech Republic and Slovakia into Germany via landscape features (Danube river system), biogenic factors (birds, red deer) and anthropogenic factors. The identification of endemic foci showing local genetic diversity is of paramount importance to the field as these will be a prerequisite for in-depth analysis of focal TBEV maintenance and long
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2013
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of General Virology
ISSN
0022-1317
e-ISSN
—
Svazek periodika
94
Číslo periodika v rámci svazku
SEP 2013
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
2129-2139
Kód UT WoS článku
000326304600020
EID výsledku v databázi Scopus
—