Molecular Characterization of Extrachromosomal DNA Accompanying Primula Red Phytoplasma

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F15%3A00443121" target="_blank" >RIV/60077344:_____/15:00443121 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://dx.doi.org/10.1111/jph.12265" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1111/jph.12265</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1111/jph.12265" target="_blank" >10.1111/jph.12265</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Molecular Characterization of Extrachromosomal DNA Accompanying Primula Red Phytoplasma

Popis výsledku v původním jazyce

The complete nucleotide sequence of an extrachromosomal element found in primula red isolate of Candidatus Phytoplasma asteris' (16SrI-B subgroup) was determined. The plasmid, named pPrR, is 4378bp in length and has 75% A+T content that is similar to that of the phytoplasma genome. It encodes six putative open reading frames (ORF) longer than 100 amino acids and two smaller ones. The structural organization of the rep gene is similar to that found in plasmids which replicate via rolling circle mechanism. Furthermore, it has homology to both the plasmid pLS1 family and helicase domains of replication-associated proteins (Rap) of eukaryotic viruses and geminiviruses. The ORF arrangement and genes sequences are most similar to the pPARG1 plasmid from Rehmannia glutinosa' phytoplasma.

Název v anglickém jazyce

Molecular Characterization of Extrachromosomal DNA Accompanying Primula Red Phytoplasma

Popis výsledku anglicky

The complete nucleotide sequence of an extrachromosomal element found in primula red isolate of Candidatus Phytoplasma asteris' (16SrI-B subgroup) was determined. The plasmid, named pPrR, is 4378bp in length and has 75% A+T content that is similar to that of the phytoplasma genome. It encodes six putative open reading frames (ORF) longer than 100 amino acids and two smaller ones. The structural organization of the rep gene is similar to that found in plasmids which replicate via rolling circle mechanism. Furthermore, it has homology to both the plasmid pLS1 family and helicase domains of replication-associated proteins (Rap) of eukaryotic viruses and geminiviruses. The ORF arrangement and genes sequences are most similar to the pPARG1 plasmid from Rehmannia glutinosa' phytoplasma.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/LD12074" target="_blank" >LD12074: Analýza genomových komponent fytoplazem a vývoj microarrays pro jejich detekci a management</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Phytopathology - Phytopathologische Zeitschrift

ISSN

0931-1785

e-ISSN

—

Svazek periodika

163

Číslo periodika v rámci svazku

3

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

222-226

Kód UT WoS článku

000349780900009

EID výsledku v databázi Scopus

—