Comparative Genome Analysis Reveals Divergent Genome Size Evolution in a Carnivorous Plant Genus
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F15%3A00450261" target="_blank" >RIV/60077344:_____/15:00450261 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216224:14740/15:00081702
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.3835/plantgenome2015.04.0021" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.3835/plantgenome2015.04.0021</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.3835/plantgenome2015.04.0021" target="_blank" >10.3835/plantgenome2015.04.0021</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Comparative Genome Analysis Reveals Divergent Genome Size Evolution in a Carnivorous Plant Genus
Popis výsledku v původním jazyce
The C-value paradox remains incompletely resolved after >40 yr and is exemplified by 2,350-fold variation in genome sizes of flowering plants. The carnivorous Lentibulariaceae genus Genlisea, displaying a 25-fold range of genome sizes, is a promising subject to study mechanisms and consequences of evolutionary genome size variation. Applying genomic, phylogenetic, and cytogenetic approaches, we uncovered bidirectional genome size evolution within the genus Genlisea. The Genlisea nigrocaulis Steyerm. genome (86 Mbp) has probably shrunk by retroelement silencing and deletion-biased double-strand break (DSB) repair, from an ancestral size of 400 to 800 Mbp to become one of the smallest among flowering plants. The G. hispidula Stapf genome has expanded bywhole-genome duplication (WGD) and retrotransposition to 1550 Mbp. Genlisea hispidula became allotetraploid after the split from the G. nigrocaulis clade 29 Ma.
Název v anglickém jazyce
Comparative Genome Analysis Reveals Divergent Genome Size Evolution in a Carnivorous Plant Genus
Popis výsledku anglicky
The C-value paradox remains incompletely resolved after >40 yr and is exemplified by 2,350-fold variation in genome sizes of flowering plants. The carnivorous Lentibulariaceae genus Genlisea, displaying a 25-fold range of genome sizes, is a promising subject to study mechanisms and consequences of evolutionary genome size variation. Applying genomic, phylogenetic, and cytogenetic approaches, we uncovered bidirectional genome size evolution within the genus Genlisea. The Genlisea nigrocaulis Steyerm. genome (86 Mbp) has probably shrunk by retroelement silencing and deletion-biased double-strand break (DSB) repair, from an ancestral size of 400 to 800 Mbp to become one of the smallest among flowering plants. The G. hispidula Stapf genome has expanded bywhole-genome duplication (WGD) and retrotransposition to 1550 Mbp. Genlisea hispidula became allotetraploid after the split from the G. nigrocaulis clade 29 Ma.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Plant Genome
ISSN
1940-3372
e-ISSN
—
Svazek periodika
8
Číslo periodika v rámci svazku
3
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
14
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000367390800008
EID výsledku v databázi Scopus
—