Highly divergent 18S rRNA gene paralogs in a Cryptosporidium genotype from eastern chipmunks (Tamias striatus)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F60077344%3A_____%2F15%3A00453300" target="_blank" >RIV/60077344:_____/15:00453300 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/60076658:12220/15:43890143
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2015.03.003" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2015.03.003</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2015.03.003" target="_blank" >10.1016/j.meegid.2015.03.003</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Highly divergent 18S rRNA gene paralogs in a Cryptosporidium genotype from eastern chipmunks (Tamias striatus)
Popis výsledku v původním jazyce
Cryptosporidium is an apicomplexan parasite that causes the disease cryptosporidiosis in humans, livestock, and other vertebrates. Much of the knowledge on Oyptosporidium diversity is derived from 18S rRNA gene (18S rDNA) phylogenies. Eukaryote genomes generally have multiple 18S rDNA copies that evolve in concert, which is necessary for the accurate inference of phylogenetic relationships. However, 18S rDNA copies in some genomes evolve by a birth-and-death process that can result in sequence divergence among copies. Most notably, divergent 18S rDNA paralogs in the apicomplexan Plasmodium share only 89-95% sequence similarity, encode structurally distinct rRNA molecules, and are expressed at different life cycle stages. In the present study, Cryptosporidium 18S rDNA was amplified from 28/72 (38.9%) eastern chipmunks (Tamias striatus). Phylogenetic analyses showed the co-occurrence of two 18S rDNA types, Type A and Type B, in 26 chipmunks, and Type B clustered with a sequence previousl
Název v anglickém jazyce
Highly divergent 18S rRNA gene paralogs in a Cryptosporidium genotype from eastern chipmunks (Tamias striatus)
Popis výsledku anglicky
Cryptosporidium is an apicomplexan parasite that causes the disease cryptosporidiosis in humans, livestock, and other vertebrates. Much of the knowledge on Oyptosporidium diversity is derived from 18S rRNA gene (18S rDNA) phylogenies. Eukaryote genomes generally have multiple 18S rDNA copies that evolve in concert, which is necessary for the accurate inference of phylogenetic relationships. However, 18S rDNA copies in some genomes evolve by a birth-and-death process that can result in sequence divergence among copies. Most notably, divergent 18S rDNA paralogs in the apicomplexan Plasmodium share only 89-95% sequence similarity, encode structurally distinct rRNA molecules, and are expressed at different life cycle stages. In the present study, Cryptosporidium 18S rDNA was amplified from 28/72 (38.9%) eastern chipmunks (Tamias striatus). Phylogenetic analyses showed the co-occurrence of two 18S rDNA types, Type A and Type B, in 26 chipmunks, and Type B clustered with a sequence previousl
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/LH11061" target="_blank" >LH11061: Diverzita, biologie a fylogenetika kryptosporidií parazitujících u hlodavců</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Infection, Genetics and Evolution
ISSN
1567-1348
e-ISSN
—
Svazek periodika
32
Číslo periodika v rámci svazku
JUN 2015
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
113-123
Kód UT WoS článku
000355027300015
EID výsledku v databázi Scopus
—